More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1220 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1220  ThiJ/PfpI  100 
 
 		 172 aa  337  4e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2403  ThiJ/PfpI domain-containing protein  66.47 
 
 		 174 aa  225  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2580  ThiJ/PfpI domain-containing protein  65.88 
 
 		 174 aa  220  9e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0105  ThiJ/PfpI domain protein  65.29 
 
 		 174 aa  217  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438693  normal  0.815938 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1646  peptidase C56, PfpI  47.34 
 
 		 174 aa  157  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0826  protease I  40.35 
 
 		 172 aa  154  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0053488  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0594  intracellular protease, PfpI family  47.09 
 
 		 174 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00956999 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0225  intracellular protease, PfpI family  44.77 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1234  PfpI family intracellular peptidase  45.51 
 
 		 204 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.845868  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1713  intracellular protease, PfpI family  43.53 
 
 		 174 aa  141  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00460546  normal  0.198806 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  40.59 
 
 		 173 aa  137  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  38.69 
 
 		 170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0118  intracellular protease, PfpI family  40.83 
 
 		 172 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0615011  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1524  ThiJ/PfpI domain protein  42.31 
 
 		 180 aa  127  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.447561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  36.9 
 
 		 170 aa  124  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1318  peptidase C56, PfpI  37.57 
 
 		 227 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4496  peptidase C56, PfpI  37.13 
 
 		 364 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0578  intracellular protease, PfpI family  37.87 
 
 		 364 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  37.93 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  33.73 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  36.31 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4771  PfpI family intracellular protease  35.33 
 
 		 366 aa  107  9.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102673  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  35.93 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3148  intracellular protease, PfpI family  32.53 
 
 		 363 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1154  intracellular protease, PfpI family  32.32 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.25545e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  34.88 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2922  ThiJ/PfpI domain protein  34.36 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0699606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  37.5 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  35.09 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  34.13 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  33.92 
 
 		 173 aa  102  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  38.86 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  37.93 
 
 		 179 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  35.23 
 
 		 187 aa  101  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  36.61 
 
 		 189 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  36 
 
 		 186 aa  101  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  37.5 
 
 		 180 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1052  intracellular protease, PfpI family  31.52 
 
 		 167 aa  101  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.426271  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  35.09 
 
 		 197 aa  101  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  35.8 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  35.67 
 
 		 189 aa  99  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  36.16 
 
 		 187 aa  98.2  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  37.71 
 
 		 180 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  36 
 
 		 184 aa  97.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.05 
 
 		 242 aa  97.8  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.643562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  38.86 
 
 		 245 aa  97.8  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3012  PfpI family intracellular peptidase  35.8 
 
 		 179 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880979 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  33.33 
 
 		 183 aa  97.4  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  34.48 
 
 		 189 aa  97.4  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  34.36 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  37.14 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  35.06 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  32.32 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  36.42 
 
 		 204 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0919  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  32.53 
 
 		 168 aa  95.5  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  33.33 
 
 		 183 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0448  protease PfpI  37.14 
 
 		 179 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  37.14 
 
 		 179 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0062  intracellular protease, PfpI family  34.16 
 
 		 169 aa  95.1  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.594492  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  35.71 
 
 		 189 aa  94.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  36.14 
 
 		 188 aa  94.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  37.57 
 
 		 191 aa  94.4  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  33.13 
 
 		 167 aa  94.4  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  33.54 
 
 		 169 aa  94.4  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  33.54 
 
 		 169 aa  94  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  35.54 
 
 		 188 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  36.42 
 
 		 241 aa  93.2  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  31.71 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  35.54 
 
 		 188 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  32 
 
 		 178 aa  92.8  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1413  ThiJ/PfpI family protein  33.53 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  32.76 
 
 		 183 aa  92  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  35 
 
 		 186 aa  91.7  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1929  PfpI family intracellular peptidase  33.72 
 
 		 171 aa  91.7  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.833537  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1963  PfpI family intracellular peptidase  33.72 
 
 		 171 aa  91.7  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.710922  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  35.52 
 
 		 189 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  33.53 
 
 		 182 aa  92  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2970  intracellular protease, PfpI family  34.34 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  37.5 
 
 		 190 aa  90.1  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  36.07 
 
 		 189 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  36 
 
 		 190 aa  89.4  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  32.57 
 
 		 182 aa  88.2  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  33.89 
 
 		 189 aa  87.4  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3590  PfpI family intracellular peptidase  34.76 
 
 		 172 aa  87.4  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.638149  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1595  PfpI family intracellular peptidase  34.88 
 
 		 199 aa  87.4  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  35.8 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  33.88 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  32.57 
 
 		 188 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  30.81 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0898  intracellular protease 1  32.18 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  33.14 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  32.18 
 
 		 182 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  33.89 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  33.14 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2318  ThiJ/PfpI domain protein  31.17 
 
 		 232 aa  85.1  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  30.86 
 
 		 181 aa  85.1  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0935  thiJ/pfpI family protein  32.18 
 
 		 171 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3449  PfpI family intracellular peptidase  33.53 
 
 		 172 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  31.58 
 
 		 172 aa  84.7  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  32.35 
 
 		 192 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>