More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2318 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2318  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 		 232 aa  461  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  38.79 
 
 		 167 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  40.99 
 
 		 167 aa  139  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  37.58 
 
 		 167 aa  135  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  39.52 
 
 		 169 aa  135  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  38.92 
 
 		 169 aa  133  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  38.04 
 
 		 168 aa  126  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0919  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  39.61 
 
 		 168 aa  126  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  36.36 
 
 		 166 aa  125  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0062  intracellular protease, PfpI family  37.27 
 
 		 169 aa  125  8.000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.594492  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  40.35 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  40.35 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  38.29 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  40.35 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  40.36 
 
 		 168 aa  122  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4771  PfpI family intracellular protease  38.25 
 
 		 366 aa  121  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102673  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  37.71 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  40.35 
 
 		 182 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  40.35 
 
 		 182 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  34.42 
 
 		 170 aa  119  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  38.24 
 
 		 183 aa  118  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4496  peptidase C56, PfpI  37.43 
 
 		 364 aa  118  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  35.33 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0225  intracellular protease, PfpI family  38.06 
 
 		 173 aa  116  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  34.32 
 
 		 189 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  36.09 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  32.54 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  38.36 
 
 		 191 aa  114  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  34.88 
 
 		 183 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5481  PfpI family intracellular peptidase  39.18 
 
 		 189 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892859  hitchhiker  0.00158499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  33.89 
 
 		 192 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  36.09 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0578  intracellular protease, PfpI family  35.75 
 
 		 364 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1154  intracellular protease, PfpI family  32.12 
 
 		 166 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.25545e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  33.89 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  40.25 
 
 		 182 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  37.21 
 
 		 181 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  33.33 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  35.67 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0753  PfpI family intracellular peptidase  35.12 
 
 		 171 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  39.62 
 
 		 182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  34.55 
 
 		 172 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  36.63 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  35.63 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  36.14 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  36.57 
 
 		 245 aa  108  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0881  PfpI family intracellular peptidase  36.36 
 
 		 191 aa  108  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.365986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  32.94 
 
 		 186 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  33.14 
 
 		 187 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  32.54 
 
 		 189 aa  108  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0751  protease I, ThiJ/PfpI family protein  34.52 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0938  thiJ/pfpI family protein  34.52 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000935342 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1595  PfpI family intracellular peptidase  33.73 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  35.88 
 
 		 187 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0802  thiJ/pfpI family protein  34.52 
 
 		 171 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0842  thiJ/pfpI family protein  34.52 
 
 		 171 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3148  intracellular protease, PfpI family  33.91 
 
 		 363 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  36.93 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  31.71 
 
 		 177 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  34.86 
 
 		 188 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0898  intracellular protease 1  34.52 
 
 		 171 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  31.67 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0826  protease I  34.19 
 
 		 172 aa  106  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0053488  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  35.5 
 
 		 187 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4439  intracellular protease 1  33.73 
 
 		 171 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.831334  normal  0.103801 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  33.73 
 
 		 187 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  34.91 
 
 		 186 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  33.71 
 
 		 193 aa  105  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  32.57 
 
 		 188 aa  104  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0935  thiJ/pfpI family protein  33.33 
 
 		 171 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  35.93 
 
 		 172 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  30.36 
 
 		 170 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  35.93 
 
 		 172 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0863  peptidase C56, PfpI  35.29 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  35.93 
 
 		 172 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  35.93 
 
 		 172 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  35.47 
 
 		 189 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  35.33 
 
 		 172 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  35.93 
 
 		 172 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3449  PfpI family intracellular peptidase  35.5 
 
 		 172 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03020  predicted intracellular protease  35.33 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  35.33 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3636  PfpI family intracellular peptidase  35.33 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4473  intracellular peptidase, PfpI family  35.33 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02971  hypothetical protein  35.33 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  33.14 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0545  PfpI family intracellular peptidase  35.33 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3345  PfpI family intracellular peptidase  35.33 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3590  PfpI family intracellular peptidase  35.93 
 
 		 172 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.638149  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  35.5 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0746  protease I, ThiJ/PfpI family protein  33.33 
 
 		 171 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  30 
 
 		 192 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  33.54 
 
 		 173 aa  102  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  32.04 
 
 		 190 aa  101  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  32.39 
 
 		 190 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  33.13 
 
 		 168 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  31.67 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  34.59 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  33.72 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1713  intracellular protease, PfpI family  32.69 
 
 		 174 aa  99.8  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00460546  normal  0.198806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>