More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2828 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2828  peptidase C56, PfpI  100 
 
 		 179 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  40.91 
 
 		 168 aa  134  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  38.46 
 
 		 173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  35.47 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  38.37 
 
 		 167 aa  120  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  34.1 
 
 		 170 aa  119  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0225  intracellular protease, PfpI family  41.21 
 
 		 173 aa  118  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  37.06 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1154  intracellular protease, PfpI family  37.91 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.25545e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  36.05 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  34.48 
 
 		 167 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  32.02 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  34.88 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1646  peptidase C56, PfpI  39.02 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  32.77 
 
 		 173 aa  107  9.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  32.2 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  30.9 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  33.52 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  30.9 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  31.46 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  31.46 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  31.28 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  31.84 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0594  intracellular protease, PfpI family  36.88 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00956999 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1234  PfpI family intracellular peptidase  37.27 
 
 		 204 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.845868  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  36.02 
 
 		 168 aa  104  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  30.86 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  31.84 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  30.17 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  32.37 
 
 		 170 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  32 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  27.72 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  29.78 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0483  intracellular protease, PfpI family  34.83 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  37.93 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  34.15 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0062  intracellular protease, PfpI family  32.75 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.594492  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  30.68 
 
 		 187 aa  99  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  44.86 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  34.52 
 
 		 178 aa  99.4  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  32.94 
 
 		 245 aa  98.6  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  33.92 
 
 		 194 aa  98.6  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  36.42 
 
 		 241 aa  98.2  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  43.1 
 
 		 193 aa  97.8  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2403  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.04 
 
 		 174 aa  97.4  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1713  intracellular protease, PfpI family  32.47 
 
 		 174 aa  96.7  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00460546  normal  0.198806 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2580  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.54 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  32.39 
 
 		 179 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  35.33 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  34.46 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  29.05 
 
 		 192 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  31.82 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  34.88 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  43.27 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  34.83 
 
 		 168 aa  96.7  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  34.13 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  34.88 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  43.27 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  43.27 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  34.13 
 
 		 182 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  34.94 
 
 		 189 aa  95.9  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  27.22 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0105  ThiJ/PfpI domain protein  36.42 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438693  normal  0.815938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0228  intracellular protease, PfpI family  33.14 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  37.9 
 
 		 185 aa  95.1  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0881  PfpI family intracellular peptidase  34.62 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.365986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3335  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42 
 
 		 194 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1035  PfpI family intracellular peptidase  43.4 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  28.98 
 
 		 189 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  42.45 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.39 
 
 		 242 aa  92.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.643562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  30.54 
 
 		 197 aa  92  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  34.55 
 
 		 180 aa  92  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1524  ThiJ/PfpI domain protein  31.82 
 
 		 180 aa  92  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.447561  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  28.09 
 
 		 181 aa  92  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5796  PfpI family intracellular peptidase  42.73 
 
 		 185 aa  92  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  32.77 
 
 		 172 aa  91.7  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  32.78 
 
 		 184 aa  91.3  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  32.95 
 
 		 189 aa  91.3  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5481  PfpI family intracellular peptidase  34.73 
 
 		 189 aa  90.9  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892859  hitchhiker  0.00158499 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  34.32 
 
 		 183 aa  90.9  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  37.5 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  32.58 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  34.13 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  28.49 
 
 		 189 aa  90.1  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2318  ThiJ/PfpI domain protein  33.11 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  30.68 
 
 		 179 aa  89  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  33.53 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0118  intracellular protease, PfpI family  36.55 
 
 		 172 aa  89.4  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0615011  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  28.49 
 
 		 177 aa  89.4  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0160  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.37 
 
 		 175 aa  88.2  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  32.3 
 
 		 188 aa  87.8  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  31.21 
 
 		 189 aa  87.8  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  32.2 
 
 		 186 aa  87.4  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  31.25 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  33.58 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2231  intracellular protease, PfpI family  33.15 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4496  peptidase C56, PfpI  35.58 
 
 		 364 aa  86.3  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  37.27 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  31.25 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>