More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3309 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3309  intracellular protease  100 
 
 		 180 aa  356  9e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0273742 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0031  ThiJ/PfpI  56.74 
 
 		 174 aa  208  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1436  PfpI family intracellular peptidase  44.97 
 
 		 171 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.567729  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1048  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.97 
 
 		 171 aa  154  7e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0334  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.38 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1578  PfpI family intracellular peptidase  43.79 
 
 		 171 aa  151  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1869  PfpI family intracellular peptidase  43.79 
 
 		 171 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0730  PfpI family intracellular peptidase  46.78 
 
 		 175 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00450948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1622  ThiJ/PfpI  41.62 
 
 		 179 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.91793 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1834  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.78 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0104188  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1055  PfpI family intracellular peptidase  38.31 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0746176  normal  0.129007 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0918  hypothetical protein  34.09 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2295  ThiJ/PfpI  34.71 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2407  ThiJ/PfpI  32.75 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1245  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  33.93 
 
 		 284 aa  95.9  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0468502  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  33.13 
 
 		 166 aa  95.5  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0257  ThiJ/PfpI domain protein  32.18 
 
 		 174 aa  94.4  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00115501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  30.72 
 
 		 167 aa  91.3  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3765  protease  31.98 
 
 		 175 aa  90.5  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  30.23 
 
 		 181 aa  89  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3874  DJ-1 family protein  32.72 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  30.12 
 
 		 167 aa  85.5  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  32.95 
 
 		 187 aa  85.1  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  30.3 
 
 		 187 aa  84.7  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  35.09 
 
 		 168 aa  84.7  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  28.98 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  30.68 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2324  DJ-1 family protein  37.67 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2038  DJ-1 family protein  37.67 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0843  ThiJ/PfpI domain protein  32.94 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  26.67 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  28.31 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  29.89 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  34.81 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  26.67 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  30.34 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00918  protease  30.68 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  28.41 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  30.64 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  32.78 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  31.46 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1646  peptidase C56, PfpI  31.64 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  30.51 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1057  DJ-1 family protein  30.82 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000197778  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4496  peptidase C56, PfpI  28.73 
 
 		 364 aa  74.7  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  28.09 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  32.34 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  27.71 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  28.82 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  29.89 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3148  intracellular protease, PfpI family  28.14 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  30.34 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  29.05 
 
 		 183 aa  72  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  30.29 
 
 		 173 aa  72  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0160  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.57 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5796  PfpI family intracellular peptidase  33.33 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  27.91 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  27.11 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4771  PfpI family intracellular protease  31.61 
 
 		 366 aa  71.2  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102673  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  31.15 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0251  DJ-1 family protein  28.92 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1318  peptidase C56, PfpI  28.99 
 
 		 227 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  29.94 
 
 		 192 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  28.57 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  28.57 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  28.07 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1245  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  27.27 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  26.78 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  29.61 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  25.73 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  27.07 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  28.57 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_127  DJ-1, 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  27.71 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0802  DJ-1/PfpI family protein  33.07 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  31.4 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11290  DJ-1 family protein  28.99 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000017657  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  28.42 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  29.17 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  29.17 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1895  PfpI family intracellular peptidase  24.85 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_002936  DET0118  DJ-1 family protein  27.11 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2863  intracellular protease, PfpI family  29.12 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125689  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0908  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  33.8 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0578  intracellular protease, PfpI family  27.78 
 
 		 364 aa  67.8  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0509  DJ-1 family protein  34.38 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  26.23 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0826  protease I  28.74 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0053488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  33.94 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  29.17 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0832  DJ-1 family protein  30 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0233882 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  30.59 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  31.4 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  31.4 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  31.4 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  30.95 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  31.4 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  31.4 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  28.24 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0225  intracellular protease, PfpI family  29.59 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0681  DJ-1 family protein  27.38 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728078  normal  0.0428535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>