More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1869 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1869  PfpI family intracellular peptidase  100 
 
 
171 aa  345  2e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1055  PfpI family intracellular peptidase  54.44 
 
 
201 aa  174  5e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0746176  normal  0.129007 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1436  PfpI family intracellular peptidase  41.76 
 
 
171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.567729  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1622  ThiJ/PfpI  47.31 
 
 
179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.91793 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0730  PfpI family intracellular peptidase  45.88 
 
 
175 aa  147  9e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00450948  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1578  PfpI family intracellular peptidase  41.61 
 
 
171 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592224  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0334  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.77 
 
 
183 aa  145  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3309  intracellular protease  43.79 
 
 
180 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0273742 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1048  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.61 
 
 
171 aa  143  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2295  ThiJ/PfpI  48.82 
 
 
188 aa  139  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0031  ThiJ/PfpI  38.46 
 
 
174 aa  139  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0918  hypothetical protein  42.51 
 
 
183 aa  135  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1245  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.69 
 
 
284 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0468502  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1834  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.86 
 
 
178 aa  110  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0104188  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  37.65 
 
 
167 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2407  ThiJ/PfpI  36.05 
 
 
193 aa  102  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  37.65 
 
 
167 aa  94  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3765  protease  36.05 
 
 
175 aa  94.4  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  33.73 
 
 
169 aa  91.3  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  36.75 
 
 
167 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  33.13 
 
 
169 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  35.84 
 
 
204 aa  87.4  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  34.3 
 
 
186 aa  87  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  33.13 
 
 
166 aa  87  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  36.99 
 
 
182 aa  87.4  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  34.88 
 
 
187 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0257  ThiJ/PfpI domain protein  30.77 
 
 
174 aa  85.1  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00115501  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  32.16 
 
 
194 aa  84.3  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  30.18 
 
 
181 aa  84.3  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  33.33 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  34.3 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  32.56 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  32.37 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  33.72 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  30.41 
 
 
186 aa  80.9  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  37.28 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  32.5 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  32.28 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  32.16 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0826  protease I  32.35 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0053488  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1154  intracellular protease, PfpI family  30.72 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.25545e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  30.95 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  30.25 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  32 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  32 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  33.33 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  33.33 
 
 
194 aa  77.4  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  31.95 
 
 
241 aa  77  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  29.88 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  30.86 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  30.36 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  32.53 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  29.71 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  32.56 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  31.29 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  33.14 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  30.29 
 
 
190 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  29.63 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  31.87 
 
 
190 aa  74.3  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2222  intracellular protease, PfpI family  40 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.648289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  30.29 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  27.49 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  33.59 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  31.25 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  31.65 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  31.98 
 
 
189 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0863  peptidase C56, PfpI  32.5 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  31.25 
 
 
178 aa  72  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  31.71 
 
 
245 aa  71.2  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11290  DJ-1 family protein  32.35 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000017657  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1780  DJ-1  35.38 
 
 
185 aa  70.9  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  30.46 
 
 
188 aa  70.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0483  intracellular protease, PfpI family  35.34 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2038  DJ-1 family protein  35.4 
 
 
191 aa  70.9  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  30.29 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  31.4 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2324  DJ-1 family protein  34.51 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1895  PfpI family intracellular peptidase  29.05 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1413  ThiJ/PfpI family protein  30.64 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0802  DJ-1/PfpI family protein  29.46 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0029  DJ-1  40.59 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  29.12 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  27.17 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  30.72 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  30.72 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0510  DJ-1 family protein  30.18 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.000981591  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  30.72 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0951  peptidase C56, PfpI  30.82 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2808 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  31.65 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  30.72 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  30.72 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  29.89 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2865  peptidase C56, PfpI  32.56 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  28.57 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  29.56 
 
 
197 aa  67.8  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0919  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  28.03 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1009  DJ-1 family protein  31.95 
 
 
183 aa  67.4  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047613  normal  0.605199 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2946  PfpI family intracellular peptidase  32.61 
 
 
195 aa  67.4  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124625  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0681  DJ-1 family protein  31.36 
 
 
203 aa  67  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728078  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0523  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  31.36 
 
 
203 aa  67  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>