More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1055 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1055  PfpI family intracellular peptidase  100 
 
 		 201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0746176  normal  0.129007 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1869  PfpI family intracellular peptidase  54.44 
 
 		 171 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1622  ThiJ/PfpI  47.93 
 
 		 179 aa  157  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.91793 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1436  PfpI family intracellular peptidase  40.24 
 
 		 171 aa  150  8.999999999999999e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.567729  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0730  PfpI family intracellular peptidase  47.65 
 
 		 175 aa  148  5e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00450948  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1578  PfpI family intracellular peptidase  39.64 
 
 		 171 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0334  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.48 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2295  ThiJ/PfpI  46.2 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1048  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.18 
 
 		 171 aa  136  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0918  hypothetical protein  38.46 
 
 		 183 aa  124  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3309  intracellular protease  38.69 
 
 		 180 aa  122  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0273742 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0031  ThiJ/PfpI  35.26 
 
 		 174 aa  117  9e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2407  ThiJ/PfpI  37.79 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1834  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.88 
 
 		 178 aa  106  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0104188  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3765  protease  40.35 
 
 		 175 aa  104  9e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1245  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  36.56 
 
 		 284 aa  100  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0468502  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  36.69 
 
 		 167 aa  97.8  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  37.87 
 
 		 167 aa  97.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0257  ThiJ/PfpI domain protein  33.91 
 
 		 174 aa  91.7  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00115501  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  34.73 
 
 		 169 aa  91.7  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  33.14 
 
 		 166 aa  91.7  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  33.53 
 
 		 169 aa  89  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1154  intracellular protease, PfpI family  34.71 
 
 		 166 aa  87  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.25545e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  36.09 
 
 		 167 aa  85.1  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11290  DJ-1 family protein  35.84 
 
 		 181 aa  85.1  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000017657  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  35.37 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  33.53 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  29.89 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1009  DJ-1 family protein  33.53 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047613  normal  0.605199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  28.81 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  29.31 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  27.17 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  26.74 
 
 		 177 aa  73.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  28.98 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3874  DJ-1 family protein  31.21 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2324  DJ-1 family protein  30.64 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2354  DJ-1 family protein  32.16 
 
 		 184 aa  72  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0457203  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  29.27 
 
 		 189 aa  72  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0483  intracellular protease, PfpI family  31.29 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  33.13 
 
 		 194 aa  71.2  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  30.43 
 
 		 181 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  29.55 
 
 		 182 aa  71.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2038  DJ-1 family protein  30.06 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0843  ThiJ/PfpI domain protein  31.21 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  28.09 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  26.7 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  30.81 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2299  DJ-1/PfpI family protein  36.67 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2828  peptidase C56, PfpI  28.41 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0898  intracellular protease 1  28.82 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  33.33 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  28.42 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  27.72 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  26.44 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  28.26 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  28.16 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1845  putative protease  31.51 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  29.81 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  27.68 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  28.26 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  30.61 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  26.16 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  27.78 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  30.23 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1245  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  31.06 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0118  DJ-1 family protein  26.99 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1262  PfpI family intracellular peptidase  35.45 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0951  peptidase C56, PfpI  26.55 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2808 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0966  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  30.18 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000883438  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0908  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  30.4 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  30.1 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0919  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  27.85 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  26.86 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0978  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  30.4 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  30.23 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  26.63 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0914  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  30.4 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2566  DJ-1 family protein  32.21 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.290389  normal  0.0127226 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0894  4-methyl-5(beta-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate synthesis protein  31.15 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.022908  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2034  DJ-1 family protein  35 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  28.4 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_127  DJ-1, 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  25.31 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0753  PfpI family intracellular peptidase  28.24 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  27.81 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  27.87 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0481  DJ-1 family protein  29.65 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.476054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6770  intracellular protease, PfpI family  28.98 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.21709  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  27.93 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0251  DJ-1 family protein  25.31 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1118  DJ-1 family protein  34.92 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0746  protease I, ThiJ/PfpI family protein  27.06 
 
 		 171 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0332  intracellular protease, PfpI family  33.33 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  26.25 
 
 		 190 aa  62  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1413  ThiJ/PfpI family protein  31.25 
 
 		 172 aa  62  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0935  thiJ/pfpI family protein  27.06 
 
 		 171 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  27.59 
 
 		 187 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0062  intracellular protease, PfpI family  28.07 
 
 		 169 aa  62  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.594492  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1981  intracellular protease, PfpI family  28.81 
 
 		 187 aa  62  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  25.88 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  25.88 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>