More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_127 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_127  DJ-1, 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  100 
 
 		 180 aa  367  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0251  DJ-1 family protein  95.56 
 
 		 180 aa  353  5.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0118  DJ-1 family protein  94.44 
 
 		 180 aa  348  2e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  47.49 
 
 		 182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  40.22 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 388 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2354  DJ-1 family protein  40.11 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0457203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1845  putative protease  41.82 
 
 		 181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11290  DJ-1 family protein  38.55 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000017657  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2019  DJ-1 family protein  40.68 
 
 		 184 aa  127  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.236764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0523  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  40 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0681  DJ-1 family protein  40 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728078  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3290  DJ-1 family protein  37.29 
 
 		 184 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1057  DJ-1 family protein  37.84 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000197778  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2566  DJ-1 family protein  38.76 
 
 		 192 aa  122  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.290389  normal  0.0127226 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0509  DJ-1 family protein  37.36 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0029  DJ-1  38.32 
 
 		 184 aa  121  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2324  DJ-1 family protein  36.81 
 
 		 191 aa  120  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2038  DJ-1 family protein  36.81 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0371  DJ-1 family protein  36.93 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00995133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1009  DJ-1 family protein  35.98 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047613  normal  0.605199 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1780  DJ-1  38.82 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1245  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  34.27 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1208  DJ-1 family protein  35.47 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0966  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  34.55 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000883438  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0481  DJ-1 family protein  34.62 
 
 		 183 aa  106  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.476054  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1523  DJ-1 family protein  31.89 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3874  DJ-1 family protein  34.25 
 
 		 183 aa  100  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0908  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  40 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0894  4-methyl-5(beta-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate synthesis protein  34.41 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.022908  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0978  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  39.38 
 
 		 189 aa  97.8  8e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0832  DJ-1 family protein  32.97 
 
 		 180 aa  97.8  8e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0233882 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0914  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  39.38 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1215  DJ-1  32.6 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2034  DJ-1 family protein  38.27 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2774  DJ-1 family protein  36.57 
 
 		 202 aa  95.5  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0326  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  30.54 
 
 		 194 aa  93.6  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000260198  hitchhiker  6.98835e-17 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl263  putative intracellular protease/amidase  27.62 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.04249e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  30.05 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0623  DJ-1 family protein  36.78 
 
 		 182 aa  90.9  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.226753  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1118  DJ-1 family protein  31.29 
 
 		 190 aa  91.3  8e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0640  putative 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  28.09 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00127997  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0833  DJ-1 family protein  32.24 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1633  protein ThiJ  29.83 
 
 		 182 aa  89.4  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32791  predicted protein  34.78 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0634  ThiJ/PfpI family protein  32.93 
 
 		 181 aa  88.6  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.403728 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0510  DJ-1 family protein  29.21 
 
 		 182 aa  88.6  5e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.000981591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2299  DJ-1/PfpI family protein  31.09 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  30.85 
 
 		 241 aa  86.3  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1238  4-methyl-5(beta-hydroxyethyl)-thiazol monophosphate biosynthesis protein-like  33.51 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  31.06 
 
 		 166 aa  85.9  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  31.21 
 
 		 194 aa  85.1  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1048  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.24 
 
 		 171 aa  84.7  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1436  PfpI family intracellular peptidase  26.32 
 
 		 171 aa  84.3  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.567729  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44270  predicted protein  32.29 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0563651 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1578  PfpI family intracellular peptidase  29.24 
 
 		 171 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4036  DJ-1 family protein  30.22 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  31.65 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  31.45 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0843  ThiJ/PfpI domain protein  31.33 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  34.62 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  32.7 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  33.33 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  31.18 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  32.67 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  32.28 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  31.95 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0160  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.99 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0334  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.71 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4895  DJ-1  29.61 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  31.69 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  30.41 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  30.68 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  33.33 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0941  protein ThiJ  30.72 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.963617  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  28.07 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  30.59 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  33.33 
 
 		 169 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  32.34 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1034  DJ-1 family protein  33.15 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463185  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  33.97 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  29.38 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  29.59 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3277  DJ-1 family protein  33.15 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  29.48 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  28.31 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1791  thiJ/pfpI family protein  27.22 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0031  ThiJ/PfpI  27.33 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3081  DJ-1 family protein  32.57 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.713776  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2890  DJ-1 family protein  32.04 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1501  thiJ/PfpI family protein  27.22 
 
 		 194 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000524776  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  29.07 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  30.57 
 
 		 186 aa  74.3  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  30.77 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  29.21 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1492  intracellular protease/amidase  27.22 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.882955  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1981  intracellular protease, PfpI family  31.21 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  31.14 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  29.21 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  29.21 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>