295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3765 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3765  protease  100 
 
 		 175 aa  362  2e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1834  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.44 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0104188  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1055  PfpI family intracellular peptidase  41.03 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0746176  normal  0.129007 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1436  PfpI family intracellular peptidase  36.26 
 
 		 171 aa  94.7  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.567729  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0730  PfpI family intracellular peptidase  34.5 
 
 		 175 aa  94.4  7e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00450948  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1869  PfpI family intracellular peptidase  36.05 
 
 		 171 aa  94.4  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3309  intracellular protease  31.98 
 
 		 180 aa  90.5  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0273742 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0031  ThiJ/PfpI  32.37 
 
 		 174 aa  87.4  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11290  DJ-1 family protein  35.84 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000017657  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0257  ThiJ/PfpI domain protein  30.81 
 
 		 174 aa  85.1  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00115501  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1578  PfpI family intracellular peptidase  35.5 
 
 		 171 aa  85.5  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1048  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.32 
 
 		 171 aa  85.5  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0918  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  84.3  7e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0334  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.32 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0843  ThiJ/PfpI domain protein  31.82 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1622  ThiJ/PfpI  29.7 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.91793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  31.37 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  31.17 
 
 		 167 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  30.43 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3874  DJ-1 family protein  31.1 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  28.14 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1780  DJ-1  29.89 
 
 		 185 aa  67  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2774  DJ-1 family protein  31.21 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0062  intracellular protease, PfpI family  26.35 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.594492  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0029  DJ-1  29.76 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  26.22 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  27.63 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  27.74 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1845  putative protease  27.65 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1724  ThiJ/PfpI  28.25 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  27.74 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  29.09 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0160  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.82 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0371  DJ-1 family protein  31.4 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00995133  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  30.41 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1245  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  30.86 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  26.45 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  31.18 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  28.83 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3590  PfpI family intracellular peptidase  29.63 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.638149  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2566  DJ-1 family protein  30.67 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.290389  normal  0.0127226 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  30.86 
 
 		 172 aa  62  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  30.86 
 
 		 172 aa  62  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  30.86 
 
 		 172 aa  62  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  30.86 
 
 		 172 aa  62  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  30.86 
 
 		 172 aa  62  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1208  DJ-1 family protein  30.46 
 
 		 188 aa  62  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  30.65 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4036  DJ-1 family protein  33.33 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3449  PfpI family intracellular peptidase  30.25 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  27.61 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  27.44 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  30.25 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0545  PfpI family intracellular peptidase  30.25 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.821975 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03020  predicted intracellular protease  30.25 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  30.25 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4473  intracellular peptidase, PfpI family  30.25 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0935  thiJ/pfpI family protein  28.57 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0753  PfpI family intracellular peptidase  27.95 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  24.84 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4496  peptidase C56, PfpI  29.75 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02971  hypothetical protein  30.25 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3345  PfpI family intracellular peptidase  30.25 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2324  DJ-1 family protein  31.1 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.31 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3636  PfpI family intracellular peptidase  30.25 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0802  thiJ/pfpI family protein  27.95 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0523  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  25.6 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017348  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0842  thiJ/pfpI family protein  27.95 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0681  DJ-1 family protein  25.6 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728078  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1245  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  28.57 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0468502  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  26.71 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  28.74 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0951  peptidase C56, PfpI  28.12 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2808 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1929  PfpI family intracellular peptidase  26.14 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.833537  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1963  PfpI family intracellular peptidase  26.14 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.710922  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  30.19 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  26.87 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0751  protease I, ThiJ/PfpI family protein  27.95 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4771  PfpI family intracellular protease  29.68 
 
 		 366 aa  58.2  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102673  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0938  thiJ/pfpI family protein  27.95 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000935342 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0898  intracellular protease 1  27.95 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2038  DJ-1 family protein  30.49 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1413  ThiJ/PfpI family protein  25.42 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2295  ThiJ/PfpI  32.57 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2354  DJ-1 family protein  30.23 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0457203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0746  protease I, ThiJ/PfpI family protein  27.95 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1646  peptidase C56, PfpI  26.59 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0510  DJ-1 family protein  26.01 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.000981591  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  27.16 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  27.78 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0509  DJ-1 family protein  30.51 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  28.83 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  28.83 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  24.36 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  24.38 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  26.51 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  28.39 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  25.97 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>