More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0031 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0031  ThiJ/PfpI  100 
 
 
174 aa  347  4e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3309  intracellular protease  56.74 
 
 
180 aa  208  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0273742 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1048  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.9 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0334  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.9 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1578  PfpI family intracellular peptidase  46.71 
 
 
171 aa  168  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592224  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1436  PfpI family intracellular peptidase  43.45 
 
 
171 aa  160  8.000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.567729  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1869  PfpI family intracellular peptidase  38.46 
 
 
171 aa  139  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1622  ThiJ/PfpI  40.91 
 
 
179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.91793 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0918  hypothetical protein  37.87 
 
 
183 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0730  PfpI family intracellular peptidase  40.48 
 
 
175 aa  119  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00450948  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1834  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.5 
 
 
178 aa  114  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0104188  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1055  PfpI family intracellular peptidase  35.26 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0746176  normal  0.129007 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2295  ThiJ/PfpI  37.87 
 
 
188 aa  107  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1245  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34.91 
 
 
284 aa  107  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0468502  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2407  ThiJ/PfpI  31.58 
 
 
193 aa  102  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0257  ThiJ/PfpI domain protein  31.79 
 
 
174 aa  94.7  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00115501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  33.13 
 
 
167 aa  94  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  32.57 
 
 
192 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  31.33 
 
 
169 aa  92.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  32 
 
 
192 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  31.33 
 
 
169 aa  91.7  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  30.59 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  32.58 
 
 
173 aa  88.2  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2038  DJ-1 family protein  37.29 
 
 
191 aa  88.2  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2324  DJ-1 family protein  36.93 
 
 
191 aa  87.8  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  32.39 
 
 
186 aa  87.4  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3765  protease  32.37 
 
 
175 aa  87.4  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  30.72 
 
 
167 aa  86.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  29.81 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  29.31 
 
 
178 aa  86.3  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0509  DJ-1 family protein  39.37 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  31.61 
 
 
189 aa  85.9  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  28.57 
 
 
192 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1895  PfpI family intracellular peptidase  31.85 
 
 
204 aa  85.5  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  31.33 
 
 
167 aa  84.7  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.84 
 
 
227 aa  84.3  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00918  protease  34.15 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  33.9 
 
 
173 aa  82  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1646  peptidase C56, PfpI  34.3 
 
 
174 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  31.68 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  30.81 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0523  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  28.9 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0681  DJ-1 family protein  28.9 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728078  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  30.95 
 
 
182 aa  82  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0919  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  31.71 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0481  DJ-1 family protein  31.71 
 
 
183 aa  80.9  0.000000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.476054  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11290  DJ-1 family protein  31.95 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000017657  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  28.07 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0966  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  30.91 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000883438  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  38.06 
 
 
194 aa  79  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2774  DJ-1 family protein  31.14 
 
 
202 aa  79  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  30.06 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  30.41 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  28.9 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1318  peptidase C56, PfpI  29.61 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  31.79 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  30.51 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0251  DJ-1 family protein  27.95 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0077  peptidase C56, PfpI  29.14 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0445898  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2019  DJ-1 family protein  30.06 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.236764  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  28.31 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0843  ThiJ/PfpI domain protein  32.75 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  29.48 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1208  DJ-1 family protein  31.08 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  26.82 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_002936  DET0118  DJ-1 family protein  27.33 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  28.82 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_127  DJ-1, 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  27.33 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  27.75 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0160  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.01 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  30.17 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  29.89 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  27.91 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3290  DJ-1 family protein  29.93 
 
 
184 aa  74.3  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0908  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  30.68 
 
 
189 aa  74.3  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  30.34 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  28.49 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4496  peptidase C56, PfpI  31.61 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4771  PfpI family intracellular protease  34.21 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102673  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  29.41 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  25 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1245  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  27.88 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  30.43 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1845  putative protease  29.53 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  28.85 
 
 
191 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  29.55 
 
 
179 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  27.06 
 
 
188 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  27.01 
 
 
189 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1981  intracellular protease, PfpI family  27.27 
 
 
187 aa  72  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0448  protease PfpI  27.32 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0978  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  30.11 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  28.9 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1413  ThiJ/PfpI family protein  30.81 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1647  PfpI family intracellular peptidase  29.05 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.920714 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2828  peptidase C56, PfpI  26.14 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0826  protease I  30.34 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0053488  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  27.17 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1057  DJ-1 family protein  28.48 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000197778  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  26.34 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  27.06 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>