More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2865 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2865  peptidase C56, PfpI  100 
 
 
193 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1604  intracellular protease, PfpI family  95.85 
 
 
193 aa  381  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.522286  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1758  PfpI family intracellular peptidase  89.12 
 
 
193 aa  358  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0834819  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0556  PfpI family intracellular peptidase  89.12 
 
 
193 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2769  PfpI family intracellular peptidase  89.12 
 
 
193 aa  354  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2131  peptidase C56, PfpI  89.12 
 
 
193 aa  354  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128883  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2743  PfpI family intracellular peptidase  89.12 
 
 
193 aa  354  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922216  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6071  peptidase C56, PfpI  89.12 
 
 
193 aa  354  5e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.910383 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2793  PfpI family intracellular peptidase  89.64 
 
 
193 aa  353  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2660  PfpI family intracellular peptidase  89.64 
 
 
193 aa  353  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0543  PfpI family intracellular peptidase  87.05 
 
 
193 aa  347  5e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0655  PfpI family intracellular peptidase  86.53 
 
 
193 aa  346  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0833  peptidase  86.53 
 
 
193 aa  345  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0671  PfpI family intracellular peptidase  86.53 
 
 
193 aa  345  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0175  PfpI family intracellular peptidase  86.53 
 
 
193 aa  344  5e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.61743  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2386  PfpI family intracellular peptidase  86.53 
 
 
193 aa  344  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2773  PfpI family intracellular peptidase  86.53 
 
 
193 aa  344  5e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2306  PfpI family intracellular peptidase  86.53 
 
 
193 aa  344  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1630  PfpI family intracellular peptidase  78.01 
 
 
192 aa  315  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3047  intracellular protease, PfpI family  71.35 
 
 
199 aa  306  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0310  peptidase C56, PfpI  76.72 
 
 
209 aa  305  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0362  peptidase C56, PfpI  75.66 
 
 
192 aa  300  7.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0025  peptidase C56, PfpI  73.06 
 
 
193 aa  300  8.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7251  intracellular protease, PfpI family  68.91 
 
 
193 aa  296  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0247532  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1994  PfpI family intracellular peptidase  72.25 
 
 
194 aa  296  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.964546  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0363  intracellular protease, PfpI family  70.9 
 
 
192 aa  293  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2859  intracellular protease, PfpI family  69.79 
 
 
200 aa  291  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3237  intracellular protease, PfpI family  69.79 
 
 
200 aa  291  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.140616 
 
 
-
 
NC_004310  BR1197  ThiJ/PfpI family protein  70.16 
 
 
194 aa  289  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1159  ThiJ/PfpI family protein  70.16 
 
 
194 aa  289  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1389  PfpI family intracellular peptidase  69.95 
 
 
193 aa  288  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0691524  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3932  PfpI family intracellular peptidase  69.95 
 
 
193 aa  287  5.0000000000000004e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253047  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0347  peptidase C56, PfpI  69.84 
 
 
192 aa  287  7e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1742  PfpI family intracellular peptidase  69.27 
 
 
193 aa  286  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.419318 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0332  intracellular protease, PfpI family  67.19 
 
 
199 aa  286  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3280  intracellular protease, PfpI family  69.43 
 
 
193 aa  285  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2023  PfpI family intracellular peptidase  68.39 
 
 
193 aa  285  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.297632  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0271  intracellular protease, PfpI family  69.84 
 
 
192 aa  284  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0416  hypothetical protein  68.78 
 
 
192 aa  283  8e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.894968  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4267  PfpI family intracellular peptidase  67.88 
 
 
193 aa  283  8e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346156  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56370  hypothetical protein  70.31 
 
 
194 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4906  hypothetical protein  70.31 
 
 
193 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0298  intracellular protease, PfpI family  69.31 
 
 
192 aa  280  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1303  peptidase C56, PfpI  67.88 
 
 
193 aa  280  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2941  PfpI family intracellular peptidase  68.45 
 
 
189 aa  280  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161732  normal  0.711333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37700  cysteine peptidase PfpI protein  68.06 
 
 
206 aa  279  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1145  PfpI family intracellular peptidase  71.04 
 
 
185 aa  277  8e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3866  PfpI family intracellular peptidase  68.06 
 
 
193 aa  276  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0998  PfpI family intracellular peptidase  67.71 
 
 
194 aa  276  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3508  intracellular protease, PfpI family  67.38 
 
 
198 aa  274  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2768  peptidase C56, PfpI  65.97 
 
 
193 aa  274  7e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.731616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0930  peptidase C56, PfpI  68.31 
 
 
185 aa  274  7e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0223631  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0893  intracellular protease, PfpI family  67.54 
 
 
195 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0932  PfpI family intracellular peptidase  67.54 
 
 
192 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3274  PfpI family intracellular peptidase  67.88 
 
 
193 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4458  PfpI family intracellular peptidase  67.54 
 
 
192 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453472  hitchhiker  0.00124261 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2424  PfpI family intracellular peptidase  64.74 
 
 
191 aa  272  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486342  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2946  PfpI family intracellular peptidase  64.77 
 
 
195 aa  269  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124625  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3803  intracellular protease, PfpI family  66.31 
 
 
198 aa  269  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3754  intracellular protease, PfpI family  63.35 
 
 
201 aa  268  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1378  ThiJ/PfpI family protein  69.95 
 
 
186 aa  266  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2475  PfpI family intracellular peptidase  67.91 
 
 
189 aa  266  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0996  PfpI family intracellular peptidase  65.1 
 
 
192 aa  266  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  hitchhiker  0.000000851254 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2995  PfpI family intracellular peptidase  69.4 
 
 
186 aa  265  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2815  PfpI family intracellular peptidase  69.4 
 
 
186 aa  264  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2898  PfpI family intracellular peptidase  69.4 
 
 
186 aa  264  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2087  peptidase C56, PfpI  65.62 
 
 
193 aa  263  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3031  intracellular protease, PfpI family  61.86 
 
 
195 aa  261  6e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.719779 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1191  PfpI family intracellular peptidase  66.49 
 
 
187 aa  261  6e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0549  intracellular protease, PfpI family  60.62 
 
 
195 aa  259  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2996  PfpI family intracellular peptidase  60.21 
 
 
192 aa  258  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0734954  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1245  intracellular protease, PfpI family  61.66 
 
 
193 aa  258  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1994  PfpI family intracellular peptidase  61.86 
 
 
204 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000215331  normal  0.308475 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1262  PfpI family intracellular peptidase  61.34 
 
 
195 aa  254  5e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1169  peptidase C56, PfpI  61.34 
 
 
255 aa  254  6e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1150  intracellular protease, PfpI family  60.21 
 
 
192 aa  254  7e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0902  peptidase C56, PfpI  59.04 
 
 
191 aa  251  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2009  intracellular protease, PfpI family  59.79 
 
 
198 aa  242  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0330  intracellular protease, PfpI family  58.95 
 
 
196 aa  240  7e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2222  intracellular protease, PfpI family  58.85 
 
 
197 aa  234  8e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.648289 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1402  intracellular protease, PfpI family  54.17 
 
 
193 aa  228  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2697  intracellular protease, PfpI family  57.45 
 
 
195 aa  226  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325284  normal  0.0728869 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4093  intracellular protease, PfpI family  54.79 
 
 
191 aa  224  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0349  intracellular protease, PfpI family  58.29 
 
 
186 aa  224  4e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4995  intracellular protease, PfpI family  52.06 
 
 
197 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.806672  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5266  PfpI family intracellular peptidase  49.48 
 
 
195 aa  207  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3696  putative intracellular protease  48.17 
 
 
189 aa  198  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.543316 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1960  hypothetical protein  41.49 
 
 
198 aa  171  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0483  intracellular protease, PfpI family  46.74 
 
 
187 aa  170  1e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1954  hypothetical protein  41.4 
 
 
194 aa  165  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0881  PfpI family intracellular peptidase  43.59 
 
 
191 aa  165  4e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.365986  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2501  intracellular protease, PfpI family  43.46 
 
 
184 aa  150  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.248652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2231  intracellular protease, PfpI family  41.94 
 
 
183 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1373  intracellular protease, PfpI family  41.4 
 
 
184 aa  147  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228619  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3045  PfpI family intracellular peptidase  38.8 
 
 
184 aa  138  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000681061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4625  intracellular protease, PfpI family  37.3 
 
 
189 aa  137  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.589393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  33.33 
 
 
169 aa  105  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  32.24 
 
 
169 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  33.87 
 
 
172 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  33.87 
 
 
172 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>