More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1389 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1389  PfpI family intracellular peptidase  100 
 
 
193 aa  400  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0691524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2023  PfpI family intracellular peptidase  77.72 
 
 
193 aa  324  6e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.297632  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3047  intracellular protease, PfpI family  81.25 
 
 
199 aa  323  9e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0025  peptidase C56, PfpI  79.27 
 
 
193 aa  320  6e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1742  PfpI family intracellular peptidase  77.08 
 
 
193 aa  319  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.419318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0893  intracellular protease, PfpI family  76.96 
 
 
195 aa  315  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2859  intracellular protease, PfpI family  78.12 
 
 
200 aa  315  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0932  PfpI family intracellular peptidase  76.44 
 
 
192 aa  313  7e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3237  intracellular protease, PfpI family  77.6 
 
 
200 aa  313  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.140616 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4458  PfpI family intracellular peptidase  75.92 
 
 
192 aa  311  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453472  hitchhiker  0.00124261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56370  hypothetical protein  75.52 
 
 
194 aa  310  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0416  hypothetical protein  77.78 
 
 
192 aa  310  9e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.894968  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37700  cysteine peptidase PfpI protein  74.35 
 
 
206 aa  310  9e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4906  hypothetical protein  76.04 
 
 
193 aa  309  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3274  PfpI family intracellular peptidase  76.17 
 
 
193 aa  309  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0332  intracellular protease, PfpI family  74.48 
 
 
199 aa  307  6.999999999999999e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0310  peptidase C56, PfpI  76.72 
 
 
209 aa  306  9e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1303  peptidase C56, PfpI  74.61 
 
 
193 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0363  intracellular protease, PfpI family  76.19 
 
 
192 aa  305  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0271  intracellular protease, PfpI family  76.19 
 
 
192 aa  305  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0996  PfpI family intracellular peptidase  73.96 
 
 
192 aa  304  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  hitchhiker  0.000000851254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0362  peptidase C56, PfpI  75.66 
 
 
192 aa  303  7e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2996  PfpI family intracellular peptidase  70.16 
 
 
192 aa  300  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0734954  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0298  intracellular protease, PfpI family  75.13 
 
 
192 aa  299  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0347  peptidase C56, PfpI  74.6 
 
 
192 aa  298  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3932  PfpI family intracellular peptidase  73.06 
 
 
193 aa  296  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253047  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2087  peptidase C56, PfpI  77.6 
 
 
193 aa  295  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3280  intracellular protease, PfpI family  73.06 
 
 
193 aa  295  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94363  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2424  PfpI family intracellular peptidase  73.16 
 
 
191 aa  293  8e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486342  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1994  PfpI family intracellular peptidase  72.77 
 
 
194 aa  292  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.964546  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1604  intracellular protease, PfpI family  70.98 
 
 
193 aa  292  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.522286  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0998  PfpI family intracellular peptidase  72.92 
 
 
194 aa  292  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2941  PfpI family intracellular peptidase  72.73 
 
 
189 aa  290  8e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161732  normal  0.711333 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2865  peptidase C56, PfpI  69.95 
 
 
193 aa  288  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2946  PfpI family intracellular peptidase  66.84 
 
 
195 aa  288  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124625  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3754  intracellular protease, PfpI family  71.73 
 
 
201 aa  286  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3803  intracellular protease, PfpI family  71.66 
 
 
198 aa  285  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2769  PfpI family intracellular peptidase  70.47 
 
 
193 aa  285  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2131  peptidase C56, PfpI  70.47 
 
 
193 aa  285  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128883  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0549  intracellular protease, PfpI family  68.91 
 
 
195 aa  286  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2743  PfpI family intracellular peptidase  70.47 
 
 
193 aa  285  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922216  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3508  intracellular protease, PfpI family  72.19 
 
 
198 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1197  ThiJ/PfpI family protein  70.16 
 
 
194 aa  285  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1159  ThiJ/PfpI family protein  70.16 
 
 
194 aa  285  2.9999999999999996e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1758  PfpI family intracellular peptidase  69.95 
 
 
193 aa  284  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0834819  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3866  PfpI family intracellular peptidase  71.2 
 
 
193 aa  283  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4267  PfpI family intracellular peptidase  69.95 
 
 
193 aa  281  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346156  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2475  PfpI family intracellular peptidase  70.74 
 
 
189 aa  281  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0556  PfpI family intracellular peptidase  69.95 
 
 
193 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1145  PfpI family intracellular peptidase  72.13 
 
 
185 aa  281  5.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6071  peptidase C56, PfpI  69.43 
 
 
193 aa  280  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.910383 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2793  PfpI family intracellular peptidase  69.95 
 
 
193 aa  280  9e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2660  PfpI family intracellular peptidase  69.95 
 
 
193 aa  280  9e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1150  intracellular protease, PfpI family  67.02 
 
 
192 aa  278  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7251  intracellular protease, PfpI family  64.25 
 
 
193 aa  276  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0247532  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3031  intracellular protease, PfpI family  67.53 
 
 
195 aa  275  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.719779 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1262  PfpI family intracellular peptidase  68.04 
 
 
195 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1630  PfpI family intracellular peptidase  66.49 
 
 
192 aa  275  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0671  PfpI family intracellular peptidase  68.39 
 
 
193 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0833  peptidase  68.39 
 
 
193 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0543  PfpI family intracellular peptidase  67.88 
 
 
193 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0655  PfpI family intracellular peptidase  67.88 
 
 
193 aa  271  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1169  peptidase C56, PfpI  65.98 
 
 
255 aa  271  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2386  PfpI family intracellular peptidase  68.39 
 
 
193 aa  270  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0175  PfpI family intracellular peptidase  68.39 
 
 
193 aa  270  7e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.61743  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2773  PfpI family intracellular peptidase  68.39 
 
 
193 aa  270  7e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2306  PfpI family intracellular peptidase  68.39 
 
 
193 aa  270  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0930  peptidase C56, PfpI  67.21 
 
 
185 aa  260  6.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0223631  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1402  intracellular protease, PfpI family  61.98 
 
 
193 aa  260  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1994  PfpI family intracellular peptidase  63.92 
 
 
204 aa  259  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000215331  normal  0.308475 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2009  intracellular protease, PfpI family  65.08 
 
 
198 aa  258  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1245  intracellular protease, PfpI family  64.25 
 
 
193 aa  258  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0330  intracellular protease, PfpI family  62.43 
 
 
196 aa  253  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2222  intracellular protease, PfpI family  64.58 
 
 
197 aa  252  3e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.648289 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1378  ThiJ/PfpI family protein  63.59 
 
 
186 aa  247  9e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1191  PfpI family intracellular peptidase  62.7 
 
 
187 aa  246  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2995  PfpI family intracellular peptidase  63.59 
 
 
186 aa  246  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2815  PfpI family intracellular peptidase  63.59 
 
 
186 aa  246  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2898  PfpI family intracellular peptidase  63.59 
 
 
186 aa  246  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2768  peptidase C56, PfpI  60.73 
 
 
193 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.731616  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2697  intracellular protease, PfpI family  62.23 
 
 
195 aa  241  5e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325284  normal  0.0728869 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0902  peptidase C56, PfpI  58.51 
 
 
191 aa  237  8e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0349  intracellular protease, PfpI family  60.43 
 
 
186 aa  230  8.000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4093  intracellular protease, PfpI family  56.38 
 
 
191 aa  229  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5266  PfpI family intracellular peptidase  50.52 
 
 
195 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4995  intracellular protease, PfpI family  52.06 
 
 
197 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.806672  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3696  putative intracellular protease  49.21 
 
 
189 aa  191  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.543316 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0881  PfpI family intracellular peptidase  49.74 
 
 
191 aa  183  1.0000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.365986  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1960  hypothetical protein  45.74 
 
 
198 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1954  hypothetical protein  45.7 
 
 
194 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0483  intracellular protease, PfpI family  47.83 
 
 
187 aa  169  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2501  intracellular protease, PfpI family  45.99 
 
 
184 aa  154  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.248652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2231  intracellular protease, PfpI family  46.24 
 
 
183 aa  153  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1373  intracellular protease, PfpI family  45.16 
 
 
184 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228619  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3045  PfpI family intracellular peptidase  40.32 
 
 
184 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000681061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4625  intracellular protease, PfpI family  38.3 
 
 
189 aa  127  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.589393 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  34.92 
 
 
173 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  37.16 
 
 
168 aa  115  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  40.36 
 
 
169 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  35.64 
 
 
172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>