More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1378 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1378  ThiJ/PfpI family protein  100 
 
 		 186 aa  381  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2815  PfpI family intracellular peptidase  97.31 
 
 		 186 aa  373  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2898  PfpI family intracellular peptidase  97.31 
 
 		 186 aa  373  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2995  PfpI family intracellular peptidase  97.31 
 
 		 186 aa  373  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1191  PfpI family intracellular peptidase  89.78 
 
 		 187 aa  348  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4906  hypothetical protein  70.65 
 
 		 193 aa  275  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56370  hypothetical protein  70.11 
 
 		 194 aa  274  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3047  intracellular protease, PfpI family  67.76 
 
 		 199 aa  272  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0930  peptidase C56, PfpI  68.65 
 
 		 185 aa  272  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0223631  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1630  PfpI family intracellular peptidase  69.4 
 
 		 192 aa  271  4.0000000000000004e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6071  peptidase C56, PfpI  71.2 
 
 		 193 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.910383 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1758  PfpI family intracellular peptidase  70.49 
 
 		 193 aa  270  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0834819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2660  PfpI family intracellular peptidase  71.74 
 
 		 193 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2793  PfpI family intracellular peptidase  71.74 
 
 		 193 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0556  PfpI family intracellular peptidase  70.65 
 
 		 193 aa  269  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2769  PfpI family intracellular peptidase  70.65 
 
 		 193 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2131  peptidase C56, PfpI  70.65 
 
 		 193 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128883  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2743  PfpI family intracellular peptidase  70.65 
 
 		 193 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922216  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2865  peptidase C56, PfpI  69.95 
 
 		 193 aa  266  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2941  PfpI family intracellular peptidase  67.93 
 
 		 189 aa  266  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161732  normal  0.711333 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1604  intracellular protease, PfpI family  70.49 
 
 		 193 aa  266  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.522286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0833  peptidase  68.48 
 
 		 193 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0671  PfpI family intracellular peptidase  68.48 
 
 		 193 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1145  PfpI family intracellular peptidase  68.65 
 
 		 185 aa  266  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0655  PfpI family intracellular peptidase  68.48 
 
 		 193 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3274  PfpI family intracellular peptidase  69.02 
 
 		 193 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0543  PfpI family intracellular peptidase  68.48 
 
 		 193 aa  264  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0175  PfpI family intracellular peptidase  68.48 
 
 		 193 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.61743  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2306  PfpI family intracellular peptidase  68.48 
 
 		 193 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2386  PfpI family intracellular peptidase  68.48 
 
 		 193 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2773  PfpI family intracellular peptidase  68.48 
 
 		 193 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2859  intracellular protease, PfpI family  66.67 
 
 		 200 aa  264  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0996  PfpI family intracellular peptidase  66.85 
 
 		 192 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  hitchhiker  0.000000851254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1303  peptidase C56, PfpI  67.39 
 
 		 193 aa  263  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37700  cysteine peptidase PfpI protein  66.3 
 
 		 206 aa  261  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3237  intracellular protease, PfpI family  66.12 
 
 		 200 aa  261  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.140616 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0362  peptidase C56, PfpI  68.31 
 
 		 192 aa  260  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0025  peptidase C56, PfpI  65.76 
 
 		 193 aa  259  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0893  intracellular protease, PfpI family  66.3 
 
 		 195 aa  258  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0310  peptidase C56, PfpI  67.76 
 
 		 209 aa  258  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0932  PfpI family intracellular peptidase  65.76 
 
 		 192 aa  257  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4458  PfpI family intracellular peptidase  65.76 
 
 		 192 aa  257  7e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453472  hitchhiker  0.00124261 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0271  intracellular protease, PfpI family  65.76 
 
 		 192 aa  257  8e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0416  hypothetical protein  65.22 
 
 		 192 aa  256  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.894968  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2023  PfpI family intracellular peptidase  63.93 
 
 		 193 aa  256  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.297632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2475  PfpI family intracellular peptidase  65.57 
 
 		 189 aa  255  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0298  intracellular protease, PfpI family  65.22 
 
 		 192 aa  253  9e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1742  PfpI family intracellular peptidase  63.93 
 
 		 193 aa  253  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419318 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7251  intracellular protease, PfpI family  63.39 
 
 		 193 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0247532  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0332  intracellular protease, PfpI family  62.3 
 
 		 199 aa  250  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4267  PfpI family intracellular peptidase  65.22 
 
 		 193 aa  248  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346156  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0347  peptidase C56, PfpI  63.04 
 
 		 192 aa  248  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2768  peptidase C56, PfpI  62.7 
 
 		 193 aa  248  5e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.731616  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0549  intracellular protease, PfpI family  59.46 
 
 		 195 aa  247  7e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0363  intracellular protease, PfpI family  63.04 
 
 		 192 aa  247  7e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1389  PfpI family intracellular peptidase  63.59 
 
 		 193 aa  247  8e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0691524  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1197  ThiJ/PfpI family protein  63.04 
 
 		 194 aa  246  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3508  intracellular protease, PfpI family  62.7 
 
 		 198 aa  246  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1245  intracellular protease, PfpI family  63.59 
 
 		 193 aa  246  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2424  PfpI family intracellular peptidase  60.43 
 
 		 191 aa  246  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486342  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1159  ThiJ/PfpI family protein  63.04 
 
 		 194 aa  246  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3866  PfpI family intracellular peptidase  63.59 
 
 		 193 aa  246  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3803  intracellular protease, PfpI family  62.16 
 
 		 198 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1994  PfpI family intracellular peptidase  63.59 
 
 		 194 aa  245  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.964546  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2946  PfpI family intracellular peptidase  62.03 
 
 		 195 aa  246  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0998  PfpI family intracellular peptidase  63.39 
 
 		 194 aa  240  9e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1262  PfpI family intracellular peptidase  61.29 
 
 		 195 aa  240  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3280  intracellular protease, PfpI family  63.04 
 
 		 193 aa  239  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94363  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0902  peptidase C56, PfpI  58.06 
 
 		 191 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3932  PfpI family intracellular peptidase  62.5 
 
 		 193 aa  238  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3031  intracellular protease, PfpI family  57.22 
 
 		 195 aa  238  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.719779 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2996  PfpI family intracellular peptidase  57.92 
 
 		 192 aa  237  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0734954  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2087  peptidase C56, PfpI  61.2 
 
 		 193 aa  236  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1150  intracellular protease, PfpI family  58.7 
 
 		 192 aa  236  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3754  intracellular protease, PfpI family  59.02 
 
 		 201 aa  234  7e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0330  intracellular protease, PfpI family  60.11 
 
 		 196 aa  233  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1169  peptidase C56, PfpI  58.06 
 
 		 255 aa  232  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1402  intracellular protease, PfpI family  56.68 
 
 		 193 aa  229  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1994  PfpI family intracellular peptidase  55.91 
 
 		 204 aa  225  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000215331  normal  0.308475 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2009  intracellular protease, PfpI family  57.92 
 
 		 198 aa  223  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2697  intracellular protease, PfpI family  55.14 
 
 		 195 aa  213  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325284  normal  0.0728869 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2222  intracellular protease, PfpI family  57.07 
 
 		 197 aa  213  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.648289 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4093  intracellular protease, PfpI family  52.69 
 
 		 191 aa  205  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0349  intracellular protease, PfpI family  53.8 
 
 		 186 aa  205  3e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4995  intracellular protease, PfpI family  49.73 
 
 		 197 aa  185  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.806672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3696  putative intracellular protease  49.18 
 
 		 189 aa  184  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.543316 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5266  PfpI family intracellular peptidase  45.25 
 
 		 195 aa  174  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1960  hypothetical protein  41.3 
 
 		 198 aa  164  8e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1954  hypothetical protein  41.08 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0483  intracellular protease, PfpI family  41.18 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0881  PfpI family intracellular peptidase  43.39 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.365986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2501  intracellular protease, PfpI family  42.7 
 
 		 184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.248652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2231  intracellular protease, PfpI family  40 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1373  intracellular protease, PfpI family  38.38 
 
 		 184 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228619  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3045  PfpI family intracellular peptidase  36.11 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000681061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4625  intracellular protease, PfpI family  34.59 
 
 		 189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.589393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  36.9 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  35.16 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  34.62 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  34.97 
 
 		 172 aa  104  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>