More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0330 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0330  intracellular protease, PfpI family  100 
 
 		 196 aa  407  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0332  intracellular protease, PfpI family  61.34 
 
 		 199 aa  261  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2424  PfpI family intracellular peptidase  61.29 
 
 		 191 aa  259  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486342  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3047  intracellular protease, PfpI family  60.73 
 
 		 199 aa  258  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2946  PfpI family intracellular peptidase  60.53 
 
 		 195 aa  257  8e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124625  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0298  intracellular protease, PfpI family  60.21 
 
 		 192 aa  254  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0271  intracellular protease, PfpI family  60.21 
 
 		 192 aa  254  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0025  peptidase C56, PfpI  60 
 
 		 193 aa  253  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1389  PfpI family intracellular peptidase  62.43 
 
 		 193 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0691524  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1994  PfpI family intracellular peptidase  60.94 
 
 		 194 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.964546  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0416  hypothetical protein  60.21 
 
 		 192 aa  251  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.894968  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56370  hypothetical protein  59.69 
 
 		 194 aa  251  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4906  hypothetical protein  59.69 
 
 		 193 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0362  peptidase C56, PfpI  59.69 
 
 		 192 aa  249  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2859  intracellular protease, PfpI family  57.59 
 
 		 200 aa  249  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2023  PfpI family intracellular peptidase  59.26 
 
 		 193 aa  249  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.297632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0930  peptidase C56, PfpI  62.57 
 
 		 185 aa  248  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0223631  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0310  peptidase C56, PfpI  60.32 
 
 		 209 aa  248  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37700  cysteine peptidase PfpI protein  59.16 
 
 		 206 aa  246  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1742  PfpI family intracellular peptidase  58.2 
 
 		 193 aa  246  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419318 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2941  PfpI family intracellular peptidase  60 
 
 		 189 aa  246  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161732  normal  0.711333 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3237  intracellular protease, PfpI family  57.07 
 
 		 200 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.140616 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3932  PfpI family intracellular peptidase  61.58 
 
 		 193 aa  245  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253047  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1197  ThiJ/PfpI family protein  58.85 
 
 		 194 aa  244  4.9999999999999997e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3754  intracellular protease, PfpI family  58.42 
 
 		 201 aa  244  4.9999999999999997e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1159  ThiJ/PfpI family protein  58.85 
 
 		 194 aa  244  4.9999999999999997e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3280  intracellular protease, PfpI family  61.58 
 
 		 193 aa  244  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94363  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1150  intracellular protease, PfpI family  58.95 
 
 		 192 aa  244  8e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1145  PfpI family intracellular peptidase  61.5 
 
 		 185 aa  244  9e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7251  intracellular protease, PfpI family  59.26 
 
 		 193 aa  242  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0247532  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1303  peptidase C56, PfpI  57.89 
 
 		 193 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0996  PfpI family intracellular peptidase  58.42 
 
 		 192 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  hitchhiker  0.000000851254 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1604  intracellular protease, PfpI family  58.95 
 
 		 193 aa  241  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.522286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1191  PfpI family intracellular peptidase  62.43 
 
 		 187 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2865  peptidase C56, PfpI  58.95 
 
 		 193 aa  240  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2996  PfpI family intracellular peptidase  56.84 
 
 		 192 aa  239  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0734954  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2769  PfpI family intracellular peptidase  59.79 
 
 		 193 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0902  peptidase C56, PfpI  58.64 
 
 		 191 aa  240  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2131  peptidase C56, PfpI  59.79 
 
 		 193 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128883  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2743  PfpI family intracellular peptidase  59.79 
 
 		 193 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922216  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2475  PfpI family intracellular peptidase  58.92 
 
 		 189 aa  239  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2660  PfpI family intracellular peptidase  60.32 
 
 		 193 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2793  PfpI family intracellular peptidase  60.32 
 
 		 193 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0556  PfpI family intracellular peptidase  59.79 
 
 		 193 aa  239  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0893  intracellular protease, PfpI family  57.67 
 
 		 195 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6071  peptidase C56, PfpI  59.79 
 
 		 193 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.910383 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4458  PfpI family intracellular peptidase  57.37 
 
 		 192 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453472  hitchhiker  0.00124261 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4267  PfpI family intracellular peptidase  60.53 
 
 		 193 aa  238  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346156  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3274  PfpI family intracellular peptidase  59.26 
 
 		 193 aa  238  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0932  PfpI family intracellular peptidase  57.14 
 
 		 192 aa  237  9e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1245  intracellular protease, PfpI family  60 
 
 		 193 aa  237  9e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0998  PfpI family intracellular peptidase  59.38 
 
 		 194 aa  236  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3866  PfpI family intracellular peptidase  59.69 
 
 		 193 aa  236  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0543  PfpI family intracellular peptidase  58.73 
 
 		 193 aa  235  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0347  peptidase C56, PfpI  58.42 
 
 		 192 aa  235  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0833  peptidase  58.73 
 
 		 193 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0363  intracellular protease, PfpI family  57.89 
 
 		 192 aa  234  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0671  PfpI family intracellular peptidase  58.73 
 
 		 193 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0655  PfpI family intracellular peptidase  58.2 
 
 		 193 aa  234  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2995  PfpI family intracellular peptidase  60.64 
 
 		 186 aa  234  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0175  PfpI family intracellular peptidase  58.73 
 
 		 193 aa  233  9e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.61743  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2386  PfpI family intracellular peptidase  58.73 
 
 		 193 aa  233  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2773  PfpI family intracellular peptidase  58.73 
 
 		 193 aa  233  9e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2306  PfpI family intracellular peptidase  58.73 
 
 		 193 aa  233  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2815  PfpI family intracellular peptidase  60.11 
 
 		 186 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2898  PfpI family intracellular peptidase  60.11 
 
 		 186 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1378  ThiJ/PfpI family protein  60.11 
 
 		 186 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1630  PfpI family intracellular peptidase  55.26 
 
 		 192 aa  231  5e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1994  PfpI family intracellular peptidase  57.29 
 
 		 204 aa  231  5e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000215331  normal  0.308475 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1402  intracellular protease, PfpI family  57.95 
 
 		 193 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2768  peptidase C56, PfpI  54.69 
 
 		 193 aa  228  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.731616  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1758  PfpI family intracellular peptidase  57.14 
 
 		 193 aa  228  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0834819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3803  intracellular protease, PfpI family  57.84 
 
 		 198 aa  227  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3508  intracellular protease, PfpI family  57.3 
 
 		 198 aa  227  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0549  intracellular protease, PfpI family  55.44 
 
 		 195 aa  227  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2087  peptidase C56, PfpI  55.26 
 
 		 193 aa  220  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4093  intracellular protease, PfpI family  52.33 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2009  intracellular protease, PfpI family  53.97 
 
 		 198 aa  217  8.999999999999998e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3031  intracellular protease, PfpI family  53.93 
 
 		 195 aa  216  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.719779 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1262  PfpI family intracellular peptidase  54.45 
 
 		 195 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1169  peptidase C56, PfpI  51.31 
 
 		 255 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2697  intracellular protease, PfpI family  53.85 
 
 		 195 aa  209  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325284  normal  0.0728869 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4995  intracellular protease, PfpI family  49.75 
 
 		 197 aa  203  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.806672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2222  intracellular protease, PfpI family  53.65 
 
 		 197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.648289 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5266  PfpI family intracellular peptidase  46.11 
 
 		 195 aa  192  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0349  intracellular protease, PfpI family  53.51 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3696  putative intracellular protease  46.84 
 
 		 189 aa  185  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.543316 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0881  PfpI family intracellular peptidase  48.7 
 
 		 191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.365986  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1960  hypothetical protein  40.64 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1954  hypothetical protein  39.04 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0483  intracellular protease, PfpI family  42.55 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2501  intracellular protease, PfpI family  42.78 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.248652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2231  intracellular protease, PfpI family  44.09 
 
 		 183 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1373  intracellular protease, PfpI family  40.32 
 
 		 184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228619  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3045  PfpI family intracellular peptidase  36.56 
 
 		 184 aa  121  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000681061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4625  intracellular protease, PfpI family  36.57 
 
 		 189 aa  107  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.589393 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0062  intracellular protease, PfpI family  32.97 
 
 		 169 aa  103  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.594492  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  34.32 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  37.5 
 
 		 169 aa  94.7  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  36.9 
 
 		 169 aa  93.2  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>