298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4995 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4995  intracellular protease, PfpI family  100 
 
 
197 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.806672  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5266  PfpI family intracellular peptidase  78.17 
 
 
195 aa  323  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2424  PfpI family intracellular peptidase  54.45 
 
 
191 aa  224  7e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486342  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3047  intracellular protease, PfpI family  54.08 
 
 
199 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0025  peptidase C56, PfpI  54.12 
 
 
193 aa  215  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56370  hypothetical protein  51.02 
 
 
194 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0362  peptidase C56, PfpI  53.61 
 
 
192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1742  PfpI family intracellular peptidase  53.09 
 
 
193 aa  212  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.419318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0310  peptidase C56, PfpI  53.65 
 
 
209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2023  PfpI family intracellular peptidase  52.58 
 
 
193 aa  212  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.297632  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0998  PfpI family intracellular peptidase  52.55 
 
 
194 aa  210  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4906  hypothetical protein  51.02 
 
 
193 aa  210  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3866  PfpI family intracellular peptidase  54.08 
 
 
193 aa  209  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1604  intracellular protease, PfpI family  52.58 
 
 
193 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.522286  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2865  peptidase C56, PfpI  52.06 
 
 
193 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3280  intracellular protease, PfpI family  53.09 
 
 
193 aa  207  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2996  PfpI family intracellular peptidase  52.36 
 
 
192 aa  207  7e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0734954  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2769  PfpI family intracellular peptidase  52.06 
 
 
193 aa  207  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2131  peptidase C56, PfpI  52.06 
 
 
193 aa  207  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128883  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2859  intracellular protease, PfpI family  50.51 
 
 
200 aa  207  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2743  PfpI family intracellular peptidase  52.06 
 
 
193 aa  207  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922216  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0556  PfpI family intracellular peptidase  52.58 
 
 
193 aa  206  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0363  intracellular protease, PfpI family  53.65 
 
 
192 aa  206  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3932  PfpI family intracellular peptidase  52.58 
 
 
193 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253047  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0271  intracellular protease, PfpI family  51.03 
 
 
192 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1994  PfpI family intracellular peptidase  52.28 
 
 
194 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.964546  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0671  PfpI family intracellular peptidase  52.58 
 
 
193 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1197  ThiJ/PfpI family protein  51.53 
 
 
194 aa  205  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0175  PfpI family intracellular peptidase  52.58 
 
 
193 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.61743  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0833  peptidase  52.58 
 
 
193 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0655  PfpI family intracellular peptidase  52.58 
 
 
193 aa  205  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1159  ThiJ/PfpI family protein  51.53 
 
 
194 aa  205  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2386  PfpI family intracellular peptidase  52.58 
 
 
193 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2773  PfpI family intracellular peptidase  52.58 
 
 
193 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2306  PfpI family intracellular peptidase  52.58 
 
 
193 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6071  peptidase C56, PfpI  51.55 
 
 
193 aa  205  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.910383 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0543  PfpI family intracellular peptidase  52.06 
 
 
193 aa  205  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0347  peptidase C56, PfpI  54.69 
 
 
192 aa  205  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0996  PfpI family intracellular peptidase  51.03 
 
 
192 aa  204  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  hitchhiker  0.000000851254 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3237  intracellular protease, PfpI family  50 
 
 
200 aa  204  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.140616 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2660  PfpI family intracellular peptidase  52.58 
 
 
193 aa  204  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2793  PfpI family intracellular peptidase  52.58 
 
 
193 aa  204  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2941  PfpI family intracellular peptidase  51.05 
 
 
189 aa  204  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161732  normal  0.711333 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4458  PfpI family intracellular peptidase  51.03 
 
 
192 aa  203  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453472  hitchhiker  0.00124261 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0330  intracellular protease, PfpI family  49.75 
 
 
196 aa  203  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37700  cysteine peptidase PfpI protein  50.51 
 
 
206 aa  202  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1389  PfpI family intracellular peptidase  52.06 
 
 
193 aa  203  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0691524  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4267  PfpI family intracellular peptidase  53.09 
 
 
193 aa  202  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346156  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7251  intracellular protease, PfpI family  51.55 
 
 
193 aa  201  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0247532  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0893  intracellular protease, PfpI family  50.52 
 
 
195 aa  201  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0298  intracellular protease, PfpI family  50.52 
 
 
192 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0416  hypothetical protein  50 
 
 
192 aa  201  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.894968  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1630  PfpI family intracellular peptidase  51.03 
 
 
192 aa  200  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0932  PfpI family intracellular peptidase  50 
 
 
192 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1758  PfpI family intracellular peptidase  50 
 
 
193 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0834819  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3274  PfpI family intracellular peptidase  50 
 
 
193 aa  197  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2946  PfpI family intracellular peptidase  48.45 
 
 
195 aa  197  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124625  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0332  intracellular protease, PfpI family  50 
 
 
199 aa  197  7e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1303  peptidase C56, PfpI  48.45 
 
 
193 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3803  intracellular protease, PfpI family  48.95 
 
 
198 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3508  intracellular protease, PfpI family  48.95 
 
 
198 aa  194  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1145  PfpI family intracellular peptidase  50.54 
 
 
185 aa  194  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2768  peptidase C56, PfpI  46.39 
 
 
193 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.731616  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1150  intracellular protease, PfpI family  49.74 
 
 
192 aa  193  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3754  intracellular protease, PfpI family  48.44 
 
 
201 aa  192  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0549  intracellular protease, PfpI family  48.47 
 
 
195 aa  191  6e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0902  peptidase C56, PfpI  45.55 
 
 
191 aa  188  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0930  peptidase C56, PfpI  48.07 
 
 
185 aa  188  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0223631  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1378  ThiJ/PfpI family protein  49.73 
 
 
186 aa  185  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2815  PfpI family intracellular peptidase  49.46 
 
 
186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2898  PfpI family intracellular peptidase  49.46 
 
 
186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2995  PfpI family intracellular peptidase  49.2 
 
 
186 aa  182  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1191  PfpI family intracellular peptidase  47.34 
 
 
187 aa  181  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1994  PfpI family intracellular peptidase  48.98 
 
 
204 aa  180  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000215331  normal  0.308475 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3031  intracellular protease, PfpI family  49.49 
 
 
195 aa  180  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.719779 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1169  peptidase C56, PfpI  47.45 
 
 
255 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4093  intracellular protease, PfpI family  44.56 
 
 
191 aa  177  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2475  PfpI family intracellular peptidase  45.03 
 
 
189 aa  176  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1262  PfpI family intracellular peptidase  46.94 
 
 
195 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2009  intracellular protease, PfpI family  46.07 
 
 
198 aa  174  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2087  peptidase C56, PfpI  47.94 
 
 
193 aa  173  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1245  intracellular protease, PfpI family  45.36 
 
 
193 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1402  intracellular protease, PfpI family  43.52 
 
 
193 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2222  intracellular protease, PfpI family  45.41 
 
 
197 aa  170  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.648289 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2697  intracellular protease, PfpI family  41.45 
 
 
195 aa  159  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325284  normal  0.0728869 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1960  hypothetical protein  42.49 
 
 
198 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1954  hypothetical protein  42.19 
 
 
194 aa  152  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0349  intracellular protease, PfpI family  40 
 
 
186 aa  144  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3696  putative intracellular protease  38.54 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.543316 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2231  intracellular protease, PfpI family  38.83 
 
 
183 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1373  intracellular protease, PfpI family  37.23 
 
 
184 aa  128  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228619  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0881  PfpI family intracellular peptidase  38.38 
 
 
191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.365986  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0483  intracellular protease, PfpI family  38.54 
 
 
187 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2501  intracellular protease, PfpI family  35.79 
 
 
184 aa  119  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.248652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3045  PfpI family intracellular peptidase  34.39 
 
 
184 aa  112  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000681061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4625  intracellular protease, PfpI family  33.16 
 
 
189 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.589393 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  30.05 
 
 
173 aa  88.6  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  32.98 
 
 
172 aa  85.9  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  31.72 
 
 
169 aa  85.9  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  32.98 
 
 
172 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>