More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3274 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3274  PfpI family intracellular peptidase  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1303  peptidase C56, PfpI  85.49 
 
 		 193 aa  344  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37700  cysteine peptidase PfpI protein  84.29 
 
 		 206 aa  335  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4906  hypothetical protein  85.34 
 
 		 193 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0893  intracellular protease, PfpI family  82.72 
 
 		 195 aa  332  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0996  PfpI family intracellular peptidase  83.25 
 
 		 192 aa  332  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  hitchhiker  0.000000851254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0932  PfpI family intracellular peptidase  82.2 
 
 		 192 aa  331  4e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4458  PfpI family intracellular peptidase  82.2 
 
 		 192 aa  331  5e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453472  hitchhiker  0.00124261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56370  hypothetical protein  83.25 
 
 		 194 aa  329  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0025  peptidase C56, PfpI  79.27 
 
 		 193 aa  318  3.9999999999999996e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2023  PfpI family intracellular peptidase  76.68 
 
 		 193 aa  311  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.297632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2946  PfpI family intracellular peptidase  73.58 
 
 		 195 aa  311  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124625  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1389  PfpI family intracellular peptidase  76.17 
 
 		 193 aa  309  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0691524  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0310  peptidase C56, PfpI  78.84 
 
 		 209 aa  308  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0362  peptidase C56, PfpI  78.84 
 
 		 192 aa  306  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1742  PfpI family intracellular peptidase  75.52 
 
 		 193 aa  305  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419318 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2941  PfpI family intracellular peptidase  76.47 
 
 		 189 aa  299  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161732  normal  0.711333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3047  intracellular protease, PfpI family  72.4 
 
 		 199 aa  298  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2859  intracellular protease, PfpI family  72.4 
 
 		 200 aa  297  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0271  intracellular protease, PfpI family  74.07 
 
 		 192 aa  296  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3237  intracellular protease, PfpI family  71.88 
 
 		 200 aa  294  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.140616 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3280  intracellular protease, PfpI family  72.54 
 
 		 193 aa  293  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94363  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3932  PfpI family intracellular peptidase  73.06 
 
 		 193 aa  293  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0298  intracellular protease, PfpI family  73.54 
 
 		 192 aa  292  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0416  hypothetical protein  73.02 
 
 		 192 aa  291  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.894968  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1994  PfpI family intracellular peptidase  72.77 
 
 		 194 aa  291  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.964546  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0998  PfpI family intracellular peptidase  73.3 
 
 		 194 aa  291  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2475  PfpI family intracellular peptidase  74.87 
 
 		 189 aa  289  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1197  ThiJ/PfpI family protein  71.73 
 
 		 194 aa  286  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1159  ThiJ/PfpI family protein  71.73 
 
 		 194 aa  286  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2996  PfpI family intracellular peptidase  69.11 
 
 		 192 aa  285  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0734954  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0363  intracellular protease, PfpI family  70.9 
 
 		 192 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3866  PfpI family intracellular peptidase  71.2 
 
 		 193 aa  282  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0347  peptidase C56, PfpI  71.96 
 
 		 192 aa  281  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1604  intracellular protease, PfpI family  70.47 
 
 		 193 aa  279  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.522286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0332  intracellular protease, PfpI family  68.59 
 
 		 199 aa  279  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0556  PfpI family intracellular peptidase  71.5 
 
 		 193 aa  278  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3803  intracellular protease, PfpI family  71.12 
 
 		 198 aa  278  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4267  PfpI family intracellular peptidase  68.39 
 
 		 193 aa  277  6e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346156  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2660  PfpI family intracellular peptidase  71.5 
 
 		 193 aa  277  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2793  PfpI family intracellular peptidase  71.5 
 
 		 193 aa  277  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2769  PfpI family intracellular peptidase  70.98 
 
 		 193 aa  276  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2131  peptidase C56, PfpI  70.98 
 
 		 193 aa  276  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128883  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2743  PfpI family intracellular peptidase  70.98 
 
 		 193 aa  276  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.922216  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1191  PfpI family intracellular peptidase  70.81 
 
 		 187 aa  274  7e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1145  PfpI family intracellular peptidase  71.58 
 
 		 185 aa  273  8e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0543  PfpI family intracellular peptidase  69.95 
 
 		 193 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7251  intracellular protease, PfpI family  65.28 
 
 		 193 aa  273  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0247532  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0833  peptidase  69.43 
 
 		 193 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6071  peptidase C56, PfpI  69.95 
 
 		 193 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.910383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2865  peptidase C56, PfpI  67.88 
 
 		 193 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0655  PfpI family intracellular peptidase  68.91 
 
 		 193 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0671  PfpI family intracellular peptidase  69.43 
 
 		 193 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0175  PfpI family intracellular peptidase  69.43 
 
 		 193 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.61743  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2306  PfpI family intracellular peptidase  69.43 
 
 		 193 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2386  PfpI family intracellular peptidase  69.43 
 
 		 193 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2773  PfpI family intracellular peptidase  69.43 
 
 		 193 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2424  PfpI family intracellular peptidase  67.89 
 
 		 191 aa  271  6e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486342  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3508  intracellular protease, PfpI family  69.52 
 
 		 198 aa  270  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1150  intracellular protease, PfpI family  65.97 
 
 		 192 aa  269  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1758  PfpI family intracellular peptidase  67.36 
 
 		 193 aa  267  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0834819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1630  PfpI family intracellular peptidase  66.49 
 
 		 192 aa  266  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2815  PfpI family intracellular peptidase  70.11 
 
 		 186 aa  266  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2898  PfpI family intracellular peptidase  70.11 
 
 		 186 aa  266  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2087  peptidase C56, PfpI  69.27 
 
 		 193 aa  265  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1378  ThiJ/PfpI family protein  69.02 
 
 		 186 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2995  PfpI family intracellular peptidase  69.02 
 
 		 186 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3754  intracellular protease, PfpI family  65.45 
 
 		 201 aa  263  8e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0549  intracellular protease, PfpI family  64.25 
 
 		 195 aa  263  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1169  peptidase C56, PfpI  63.4 
 
 		 255 aa  261  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0930  peptidase C56, PfpI  67.21 
 
 		 185 aa  259  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0223631  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3031  intracellular protease, PfpI family  64.43 
 
 		 195 aa  259  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.719779 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2768  peptidase C56, PfpI  65.79 
 
 		 193 aa  258  4e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.731616  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1402  intracellular protease, PfpI family  63.02 
 
 		 193 aa  255  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1245  intracellular protease, PfpI family  64.25 
 
 		 193 aa  255  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1262  PfpI family intracellular peptidase  61.66 
 
 		 195 aa  249  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2009  intracellular protease, PfpI family  61.38 
 
 		 198 aa  245  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1994  PfpI family intracellular peptidase  61.86 
 
 		 204 aa  241  6e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000215331  normal  0.308475 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2222  intracellular protease, PfpI family  60.42 
 
 		 197 aa  238  4e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.648289 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0330  intracellular protease, PfpI family  59.26 
 
 		 196 aa  238  5e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2697  intracellular protease, PfpI family  59.04 
 
 		 195 aa  229  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325284  normal  0.0728869 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0902  peptidase C56, PfpI  55.32 
 
 		 191 aa  228  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0349  intracellular protease, PfpI family  58.29 
 
 		 186 aa  222  3e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4093  intracellular protease, PfpI family  51.6 
 
 		 191 aa  207  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3696  putative intracellular protease  49.74 
 
 		 189 aa  197  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.543316 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4995  intracellular protease, PfpI family  50 
 
 		 197 aa  197  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.806672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5266  PfpI family intracellular peptidase  47.4 
 
 		 195 aa  195  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1960  hypothetical protein  43.46 
 
 		 198 aa  182  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1954  hypothetical protein  43.92 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0881  PfpI family intracellular peptidase  43.59 
 
 		 191 aa  159  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.365986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0483  intracellular protease, PfpI family  45.65 
 
 		 187 aa  159  3e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2501  intracellular protease, PfpI family  41.18 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.248652  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1373  intracellular protease, PfpI family  40.86 
 
 		 184 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228619  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2231  intracellular protease, PfpI family  41.4 
 
 		 183 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3045  PfpI family intracellular peptidase  39.25 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000681061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4625  intracellular protease, PfpI family  36.57 
 
 		 189 aa  121  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.589393 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4439  intracellular protease 1  35.48 
 
 		 171 aa  105  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.831334  normal  0.103801 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0898  intracellular protease 1  35.48 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  32.28 
 
 		 173 aa  102  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0751  protease I, ThiJ/PfpI family protein  35.14 
 
 		 171 aa  101  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>