More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0802 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0802  DJ-1/PfpI family protein  100 
 
 
207 aa  425  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2299  DJ-1/PfpI family protein  50.26 
 
 
193 aa  192  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0486  ThiJ/PfpI domain protein  40.21 
 
 
193 aa  152  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2324  DJ-1 family protein  32.64 
 
 
191 aa  93.2  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2038  DJ-1 family protein  32.64 
 
 
191 aa  92.8  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0510  DJ-1 family protein  31.61 
 
 
182 aa  86.7  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.000981591  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  29.69 
 
 
182 aa  85.9  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0908  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  29.8 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0509  DJ-1 family protein  29.26 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1578  PfpI family intracellular peptidase  34.65 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592224  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0978  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  29.29 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11290  DJ-1 family protein  30.37 
 
 
181 aa  77.8  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000017657  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  28.72 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  29.74 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0914  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  29.29 
 
 
189 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3874  DJ-1 family protein  26.56 
 
 
183 aa  77  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0334  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1245  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  28.88 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1048  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.5 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  30.48 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  28.06 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  25.93 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0843  ThiJ/PfpI domain protein  25.53 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1208  DJ-1 family protein  27.98 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1436  PfpI family intracellular peptidase  30.61 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.567729  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1057  DJ-1 family protein  29.9 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000197778  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1780  DJ-1  27.32 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  30.98 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  29.51 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1215  DJ-1  26.04 
 
 
185 aa  72  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0523  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  26.02 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0681  DJ-1 family protein  26.02 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728078  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3290  DJ-1 family protein  28.5 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1594  ThiJ/PfpI domain protein  29.83 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157689 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  28.4 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  32.59 
 
 
187 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4371  transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107025  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  29.47 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1009  DJ-1 family protein  28.5 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047613  normal  0.605199 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  27.55 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0826  protease I  36.46 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0053488  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2318  ThiJ/PfpI domain protein  30.53 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1869  PfpI family intracellular peptidase  29.46 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0832  DJ-1 family protein  26.34 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0233882 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0894  4-methyl-5(beta-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate synthesis protein  28.5 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.022908  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1118  DJ-1 family protein  26.86 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3309  intracellular protease  33.07 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0273742 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2034  DJ-1 family protein  31.69 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0029  DJ-1  26.53 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1633  protein ThiJ  28.19 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  32.61 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1845  putative protease  30.17 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  32.2 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  28.65 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0833  DJ-1 family protein  28.5 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620178  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  27.22 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0031  ThiJ/PfpI  30.51 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2566  DJ-1 family protein  24.24 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.290389  normal  0.0127226 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  26.94 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1052  intracellular protease, PfpI family  28.66 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.426271  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  28.66 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  28.66 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0919  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  30.49 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0371  DJ-1 family protein  25.93 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00995133  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0251  DJ-1 family protein  24.74 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3131  transcription regulator  27.27 
 
 
303 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  27.78 
 
 
168 aa  64.3  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0118  DJ-1 family protein  24.74 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  27.98 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0640  putative 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  26.49 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00127997  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  26.97 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1318  peptidase C56, PfpI  26.54 
 
 
227 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2019  DJ-1 family protein  27.47 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.236764  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  27.13 
 
 
189 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_127  DJ-1, 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  24.74 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0863  peptidase C56, PfpI  25.13 
 
 
188 aa  63.2  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0481  DJ-1 family protein  25.13 
 
 
183 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.476054  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2477  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.66 
 
 
185 aa  62.8  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  26.57 
 
 
228 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0881  PfpI family intracellular peptidase  31.43 
 
 
191 aa  62.8  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.365986  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1190  intracellular protease, PfpI family  35.05 
 
 
170 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.311369  normal  0.0141697 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3203  thiJ/pfpI family protein  28.4 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0422011  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl263  putative intracellular protease/amidase  26.02 
 
 
181 aa  60.8  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.04249e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  30.41 
 
 
168 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  30.84 
 
 
191 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0160  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.95 
 
 
175 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  28.66 
 
 
181 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0634  ThiJ/PfpI family protein  26.6 
 
 
181 aa  60.5  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.403728 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1857  transcriptional regulator, AraC family  31.19 
 
 
342 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 
349 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2697  intracellular protease, PfpI family  30 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325284  normal  0.0728869 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0326  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  32.02 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000260198  hitchhiker  6.98835e-17 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  27.17 
 
 
241 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1389  PfpI family intracellular peptidase  28.74 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0691524  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1734  intracellular protease, PfpI family  30.7 
 
 
170 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0443029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  27.06 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4150  ThiJ/PfpI domain protein  25.26 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  25.49 
 
 
227 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  24.19 
 
 
190 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  29.81 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>