More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4371 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4371  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 307 aa  608  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107025  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2168  transcriptional regulator, AraC family  68.9 
 
 		 320 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3131  transcription regulator  58.42 
 
 		 303 aa  338  9e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0339  transcriptional regulator, AraC family  57.24 
 
 		 295 aa  288  6e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2950  transcriptional regulator, AraC family  37.92 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3952  transcriptional regulator  40.33 
 
 		 326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.292576  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0159  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  36.48 
 
 		 327 aa  162  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0170  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 327 aa  162  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  35.69 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  37.71 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0075  transcriptional regulator, AraC family  36.95 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5056  transcriptional regulator, AraC family  36.88 
 
 		 336 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0278301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  36.33 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  38.21 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4300  transcriptional regulator, AraC family  36.33 
 
 		 336 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  33.87 
 
 		 319 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 346 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  37.86 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 319 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 312 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 324 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 336 aa  148  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  38.03 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  33.78 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 316 aa  145  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0094  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  39.1 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  34.71 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0758  transcriptional regulator  36.86 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.182304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  37.28 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  36.29 
 
 		 318 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  33.88 
 
 		 321 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 316 aa  143  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  37.41 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 338 aa  142  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 342 aa  142  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  37.42 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  34.63 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  34.3 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.41 
 
 		 338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  34.29 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  36.12 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  32.9 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  34.29 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  35.28 
 
 		 322 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  41.25 
 
 		 356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  34.29 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  34.29 
 
 		 320 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 334 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1966  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 329 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.327518  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3002  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 336 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 387 aa  139  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  37.58 
 
 		 333 aa  139  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 312 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  36.76 
 
 		 322 aa  139  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  36.39 
 
 		 311 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  36.39 
 
 		 311 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 317 aa  139  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  30.49 
 
 		 349 aa  139  8.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  35.52 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  34.32 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  31.15 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  35.06 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  34.07 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2618  AraC family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  33.44 
 
 		 331 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  34.44 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  34.88 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  34.77 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  34.02 
 
 		 346 aa  136  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  33.98 
 
 		 318 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  48.13 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 335 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  32.27 
 
 		 335 aa  136  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 347 aa  136  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 338 aa  136  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  35.35 
 
 		 334 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 331 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 320 aa  135  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  33.66 
 
 		 318 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 351 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  33.66 
 
 		 318 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  33.66 
 
 		 318 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  33.66 
 
 		 318 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  36.5 
 
 		 350 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  37.54 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>