More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5056 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5056  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 336 aa  672    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0278301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4300  transcriptional regulator, AraC family  88.1 
 
 		 336 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0758  transcriptional regulator  67.58 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.182304  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2923  transcriptional regulator AraC family  63.58 
 
 		 333 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283298  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2618  AraC family transcriptional regulator  66.34 
 
 		 333 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3940  AraC family transcriptional regulator  56.66 
 
 		 366 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.15431 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0170  AraC family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 327 aa  256  5e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0159  transcriptional regulator  44.22 
 
 		 298 aa  253  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0075  transcriptional regulator, AraC family  45.54 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2523  AraC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0094  AraC family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3002  AraC family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 336 aa  222  9e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1966  AraC family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.327518  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2950  transcriptional regulator, AraC family  35.67 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  37.39 
 
 		 319 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  36.53 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2168  transcriptional regulator, AraC family  39.56 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1461  transcriptional regulator, AraC family  38.97 
 
 		 331 aa  172  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  37.06 
 
 		 321 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 331 aa  169  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  33.23 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3952  transcriptional regulator  34.66 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.292576  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  35.22 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  37.77 
 
 		 320 aa  162  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  32.25 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 		 341 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  32.42 
 
 		 354 aa  159  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 328 aa  159  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  34.95 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  36.97 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.45 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 321 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  37.19 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  30.67 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  32.31 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4371  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107025  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  36.22 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 346 aa  152  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 329 aa  152  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3892  transcriptional regulator, AraC family  36.53 
 
 		 332 aa  153  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  35.78 
 
 		 334 aa  153  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 344 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 344 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 344 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  38.27 
 
 		 333 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 344 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  33.54 
 
 		 328 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  34.34 
 
 		 345 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  29.01 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  32.22 
 
 		 356 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  35.28 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  35.28 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  34.88 
 
 		 362 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 348 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  35.12 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 387 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  32.63 
 
 		 326 aa  149  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  35.76 
 
 		 341 aa  149  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  31.53 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  35.62 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  35.45 
 
 		 338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  34.76 
 
 		 369 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 346 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  34.76 
 
 		 369 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 346 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 346 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 343 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  34.76 
 
 		 374 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 		 319 aa  146  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 348 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  33.43 
 
 		 321 aa  146  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  35.38 
 
 		 334 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  35.08 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>