More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4300 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4300  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 336 aa  672    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5056  transcriptional regulator, AraC family  88.1 
 
 		 336 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0278301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0758  transcriptional regulator  68.92 
 
 		 338 aa  417  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.182304  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2618  AraC family transcriptional regulator  66.99 
 
 		 333 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2923  transcriptional regulator AraC family  63.27 
 
 		 333 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283298  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3940  AraC family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.15431 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0075  transcriptional regulator, AraC family  46.56 
 
 		 307 aa  255  8e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0170  AraC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 327 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0159  transcriptional regulator  44.81 
 
 		 298 aa  249  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0094  AraC family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2523  AraC family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 329 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3002  AraC family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1966  AraC family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.327518  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 324 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  35.65 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3952  transcriptional regulator  35.49 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.292576  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2950  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1461  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 331 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  35.91 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  33.54 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2168  transcriptional regulator, AraC family  36.94 
 
 		 320 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 346 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  32.91 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.91 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  32.21 
 
 		 341 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 334 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  34.2 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  31.6 
 
 		 354 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  34.2 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 348 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4371  transcriptional regulator, AraC family  36.33 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107025  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 348 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  31.27 
 
 		 341 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  31.29 
 
 		 358 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  37.07 
 
 		 356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  35.78 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3892  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  32.92 
 
 		 328 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  31.23 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  27.64 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  34.55 
 
 		 338 aa  146  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 321 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  35.26 
 
 		 317 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  33.53 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 321 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  31.83 
 
 		 326 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  34.35 
 
 		 341 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 341 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 331 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  34.67 
 
 		 338 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  34.43 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  36.15 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  34.97 
 
 		 369 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  36.15 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  34.97 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  32.71 
 
 		 335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  34.97 
 
 		 369 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  36.15 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 344 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  36.15 
 
 		 344 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  36.15 
 
 		 344 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  36.15 
 
 		 344 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0227  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 357 aa  139  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 327 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  32.74 
 
 		 334 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>