More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0094 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0094  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
307 aa  623  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0075  transcriptional regulator, AraC family  70.31 
 
 
307 aa  432  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0159  transcriptional regulator  64.07 
 
 
298 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3002  AraC family transcriptional regulator  46.1 
 
 
336 aa  257  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2523  AraC family transcriptional regulator  46.2 
 
 
329 aa  255  6e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1966  AraC family transcriptional regulator  44.69 
 
 
329 aa  255  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.327518  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5056  transcriptional regulator, AraC family  45.48 
 
 
336 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0278301  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4300  transcriptional regulator, AraC family  45.1 
 
 
336 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0758  transcriptional regulator  46.69 
 
 
338 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.182304  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2923  transcriptional regulator AraC family  42.86 
 
 
333 aa  235  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283298  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0170  AraC family transcriptional regulator  41.35 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2618  AraC family transcriptional regulator  44.08 
 
 
333 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1461  transcriptional regulator, AraC family  45.78 
 
 
331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3940  AraC family transcriptional regulator  44.19 
 
 
366 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.15431 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3952  transcriptional regulator  36.3 
 
 
326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.292576  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2950  transcriptional regulator, AraC family  34.81 
 
 
305 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  36.18 
 
 
324 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2168  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 
320 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4371  transcriptional regulator, AraC family  34.8 
 
 
307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107025  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3131  transcription regulator  35.17 
 
 
303 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5828  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 
312 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  32.9 
 
 
319 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1009  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
549 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.662069  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  36.76 
 
 
333 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  32.48 
 
 
321 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  32.57 
 
 
328 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 
329 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 
348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
321 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
321 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 
320 aa  136  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  29.58 
 
 
344 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 
338 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  32.15 
 
 
321 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  35.39 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  30.52 
 
 
328 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  31.96 
 
 
346 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 
344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  37 
 
 
345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 
344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 
344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  36.5 
 
 
344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 
344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 
344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 
344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  30.62 
 
 
361 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 
338 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  29.58 
 
 
316 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 
314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0339  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 
295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  31.15 
 
 
341 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
351 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  31.51 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  34.57 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  40.61 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  33.85 
 
 
328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3881  transcriptional regulator  32.27 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  31.35 
 
 
336 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  31.11 
 
 
341 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  32.34 
 
 
312 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  36.9 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 
316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  32.27 
 
 
338 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 
322 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  31.51 
 
 
310 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1900  transcriptional regulator  36.3 
 
 
320 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  32.68 
 
 
312 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  30.48 
 
 
334 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  39.39 
 
 
314 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  38.78 
 
 
331 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  30.55 
 
 
319 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 
326 aa  123  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 
331 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  30.35 
 
 
324 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  31.94 
 
 
317 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  29.9 
 
 
335 aa  123  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  34.2 
 
 
330 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  29.78 
 
 
327 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 
324 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 
324 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  29.81 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  34.63 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  29.22 
 
 
349 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 
324 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  30.15 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  31.83 
 
 
357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  31.83 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 
334 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
321 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 
322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 
356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 
319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 
336 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  37.56 
 
 
311 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  30.94 
 
 
323 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
348 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>