More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2168 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2168  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 320 aa  634    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4371  transcriptional regulator, AraC family  68.17 
 
 		 307 aa  385  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107025  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3131  transcription regulator  60.76 
 
 		 303 aa  339  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0339  transcriptional regulator, AraC family  59.26 
 
 		 295 aa  282  7.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2950  transcriptional regulator, AraC family  40.94 
 
 		 305 aa  198  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0159  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  39.61 
 
 		 327 aa  175  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3952  transcriptional regulator  36.98 
 
 		 326 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.292576  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5056  transcriptional regulator, AraC family  39.54 
 
 		 336 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0278301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0075  transcriptional regulator, AraC family  37.88 
 
 		 307 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  38.73 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 322 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  41.25 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  38.19 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  38.16 
 
 		 317 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  37 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0094  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  36.01 
 
 		 319 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1966  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.327518  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0170  AraC family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 327 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 324 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.34 
 
 		 338 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  36.22 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4300  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  38.31 
 
 		 322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  36.84 
 
 		 328 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  35.5 
 
 		 331 aa  152  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3002  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 336 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0758  transcriptional regulator  37.85 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.182304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  36.05 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  37.1 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  37.1 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  36.1 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  37.06 
 
 		 323 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2523  AraC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 329 aa  146  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 341 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 343 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  33.99 
 
 		 314 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 346 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 346 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 346 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  37.7 
 
 		 369 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  37.7 
 
 		 369 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  37.07 
 
 		 310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  37.7 
 
 		 374 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3166  AraC family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 312 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  32.81 
 
 		 318 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5202  AraC family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 312 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0605893 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4365  AraC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 324 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 324 aa  142  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  35.92 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  32.8 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  35.08 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  35.67 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  35.67 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6170  AraC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396266 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  34.08 
 
 		 321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  39.87 
 
 		 356 aa  139  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  34.19 
 
 		 321 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  39.02 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 334 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 342 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  34.2 
 
 		 315 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  34.19 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  35.44 
 
 		 324 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 331 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 315 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  38.63 
 
 		 333 aa  139  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2618  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 333 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  36.39 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  36.92 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  35.31 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  32.81 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  41.15 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>