More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2523 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2523  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 329 aa  654    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3002  AraC family transcriptional regulator  75.62 
 
 		 336 aa  484  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1966  AraC family transcriptional regulator  71.47 
 
 		 329 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.327518  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1461  transcriptional regulator, AraC family  69.06 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0159  transcriptional regulator  46.84 
 
 		 298 aa  264  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0170  AraC family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 327 aa  243  5e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5056  transcriptional regulator, AraC family  42.55 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0278301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0094  AraC family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4300  transcriptional regulator, AraC family  42.27 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0075  transcriptional regulator, AraC family  45.51 
 
 		 307 aa  232  8.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0758  transcriptional regulator  45.43 
 
 		 338 aa  225  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.182304  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2923  transcriptional regulator AraC family  41.34 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283298  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2618  AraC family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3940  AraC family transcriptional regulator  42.94 
 
 		 366 aa  179  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.15431 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3952  transcriptional regulator  34.31 
 
 		 326 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.292576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2168  transcriptional regulator, AraC family  34.27 
 
 		 320 aa  146  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 334 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 324 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2950  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 305 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 331 aa  132  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  30.46 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4371  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 		 307 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107025  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  29.74 
 
 		 344 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  30.62 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 334 aa  122  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  29.37 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 344 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  29.04 
 
 		 344 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  29.04 
 
 		 344 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  29.04 
 
 		 344 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 331 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3131  transcription regulator  31.46 
 
 		 303 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  29.84 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  30.03 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 		 328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  29.93 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  31.78 
 
 		 342 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 321 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 321 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 328 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  27.24 
 
 		 349 aa  115  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  29.18 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.09 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  32.5 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  31.27 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  27.5 
 
 		 349 aa  114  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 329 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  29.35 
 
 		 361 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  28.34 
 
 		 310 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 		 327 aa  113  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  30.72 
 
 		 341 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 338 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5148  AraC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0642429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2164  transcriptional regulator  32.59 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.0201995 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  28.8 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3881  transcriptional regulator  30.39 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1880  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  35.15 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 326 aa  109  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  32.01 
 
 		 319 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  28.8 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  31.28 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  32.23 
 
 		 319 aa  106  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 346 aa  106  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  28.8 
 
 		 338 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4365  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 324 aa  105  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 322 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0227  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 324 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1900  transcriptional regulator  29.97 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  29.97 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4095  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4745  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  31.46 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3422  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>