More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3952 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3952  transcriptional regulator  100 
 
 		 326 aa  665    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.292576  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0170  AraC family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0159  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4371  transcriptional regulator, AraC family  40.8 
 
 		 307 aa  182  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107025  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0075  transcriptional regulator, AraC family  36.86 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2168  transcriptional regulator, AraC family  36.98 
 
 		 320 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0094  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2923  transcriptional regulator AraC family  35.83 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283298  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4300  transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 336 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0758  transcriptional regulator  37.15 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.182304  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5056  transcriptional regulator, AraC family  35.33 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0278301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2950  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  33.13 
 
 		 328 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2523  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 329 aa  159  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  36.02 
 
 		 321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  29.57 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2618  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  36.4 
 
 		 345 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  36.4 
 
 		 344 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 344 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  36.4 
 
 		 344 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  36.4 
 
 		 344 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  36.4 
 
 		 344 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  36.4 
 
 		 344 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.54 
 
 		 338 aa  152  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  30.94 
 
 		 358 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 344 aa  152  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  32.83 
 
 		 342 aa  152  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  32.62 
 
 		 334 aa  152  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 324 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 324 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 324 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  33.03 
 
 		 319 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 331 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 319 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  30.79 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 338 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  31.99 
 
 		 362 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  29.14 
 
 		 344 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3131  transcription regulator  36.39 
 
 		 303 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  31 
 
 		 327 aa  149  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  30.82 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  32.7 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3002  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  30.25 
 
 		 319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  34.8 
 
 		 349 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  31.55 
 
 		 327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  30.75 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  31.08 
 
 		 316 aa  145  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  32.81 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 335 aa  143  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  30.25 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  30.09 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 		 331 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  33.43 
 
 		 327 aa  142  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 344 aa  142  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 330 aa  142  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 322 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 321 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  30.18 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  30.5 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1880  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 327 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  30.79 
 
 		 331 aa  139  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  29.43 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  28.97 
 
 		 361 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 348 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  31.11 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  31.33 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5148  AraC family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0642429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  30.95 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 321 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0339  transcriptional regulator, AraC family  36.16 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>