More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0339 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0339  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 295 aa  577  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2168  transcriptional regulator, AraC family  58.92 
 
 		 320 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4371  transcriptional regulator, AraC family  55.9 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107025  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3131  transcription regulator  55.59 
 
 		 303 aa  288  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 324 aa  221  9e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3952  transcriptional regulator  36.75 
 
 		 326 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.292576  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2950  transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0159  transcriptional regulator  34.56 
 
 		 298 aa  155  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0170  AraC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  36.15 
 
 		 319 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.74 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  35.81 
 
 		 319 aa  145  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0094  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  31.8 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0075  transcriptional regulator, AraC family  34.6 
 
 		 307 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 338 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 336 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  34.45 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5056  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0278301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  35.08 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  36.03 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0758  transcriptional regulator  35.83 
 
 		 338 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.182304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 338 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 322 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  33.78 
 
 		 331 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  37.46 
 
 		 338 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  34.11 
 
 		 362 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  37.82 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  36.7 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3166  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5202  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0605893 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 326 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  32.24 
 
 		 327 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7238  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402407  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  27.39 
 
 		 334 aa  132  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  35.41 
 
 		 311 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4300  transcriptional regulator, AraC family  35.76 
 
 		 336 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  35.41 
 
 		 311 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  35.47 
 
 		 321 aa  132  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 361 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5828  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0152  transcriptional regulator, AraC family  34.46 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.143566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  33.55 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  39.62 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  32.23 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  33.45 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0208  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.12 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0903161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 336 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 338 aa  128  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  34.24 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2618  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1880  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1009  AraC family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 549 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.662069  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2523  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 329 aa  126  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 321 aa  125  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5953  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 315 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 346 aa  126  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2923  transcriptional regulator AraC family  33.33 
 
 		 333 aa  125  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283298  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 387 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6258  AraC family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 315 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 328 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  32.15 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  35.02 
 
 		 326 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  34.23 
 
 		 342 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  35.02 
 
 		 326 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  32.55 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  29.24 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0719  transcriptional regulator, AraC family  38.39 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 321 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  33.78 
 
 		 311 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  37.21 
 
 		 320 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  31.61 
 
 		 335 aa  123  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  34.68 
 
 		 326 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3880  AraC family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 315 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511713 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  37.21 
 
 		 320 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 317 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  37.21 
 
 		 320 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2955  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  33.78 
 
 		 328 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 319 aa  122  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 		 349 aa  122  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 312 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>