More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2923 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2923  transcriptional regulator AraC family  100 
 
 		 333 aa  671    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283298  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4300  transcriptional regulator, AraC family  63.26 
 
 		 336 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5056  transcriptional regulator, AraC family  63.58 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0278301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0758  transcriptional regulator  62.62 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.182304  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2618  AraC family transcriptional regulator  60.32 
 
 		 333 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3940  AraC family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.15431 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0170  AraC family transcriptional regulator  40.06 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2523  AraC family transcriptional regulator  41.34 
 
 		 329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0094  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0159  transcriptional regulator  40.65 
 
 		 298 aa  235  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0075  transcriptional regulator, AraC family  42.9 
 
 		 307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1966  AraC family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 329 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.327518  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3002  AraC family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 336 aa  225  8e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 324 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1461  transcriptional regulator, AraC family  41.87 
 
 		 331 aa  189  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3952  transcriptional regulator  35.83 
 
 		 326 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.292576  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  33.54 
 
 		 321 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  33.74 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2950  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 348 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  30.53 
 
 		 344 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 361 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 346 aa  155  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  30.89 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  32.92 
 
 		 319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  33.85 
 
 		 328 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  32.59 
 
 		 319 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.75 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  32.3 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 321 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 321 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 321 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 331 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  32.39 
 
 		 336 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  33.54 
 
 		 328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2168  transcriptional regulator, AraC family  32.92 
 
 		 320 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  32.22 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 319 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  33.96 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  31.91 
 
 		 334 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 338 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  30.6 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  31.55 
 
 		 362 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4371  transcriptional regulator, AraC family  33.89 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107025  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4095  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 336 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  32.21 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4745  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 336 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3422  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 336 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  30.27 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  32.21 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  29.85 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  32.94 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  32.48 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0227  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  32.48 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  36.16 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 343 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  31.79 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 341 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 336 aa  136  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 348 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  33.56 
 
 		 344 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  33.56 
 
 		 344 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  33.56 
 
 		 345 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  31.75 
 
 		 341 aa  135  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 344 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  26.69 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  32.52 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  33.88 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>