More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2950 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2950  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 305 aa  634    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 324 aa  222  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2168  transcriptional regulator, AraC family  40.94 
 
 		 320 aa  198  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4371  transcriptional regulator, AraC family  37.67 
 
 		 307 aa  188  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107025  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3131  transcription regulator  37.33 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5056  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 336 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0278301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0159  transcriptional regulator  35.64 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0094  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 307 aa  169  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 317 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  35.02 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  36.66 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4300  transcriptional regulator, AraC family  34.88 
 
 		 336 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  32.89 
 
 		 338 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  35.4 
 
 		 319 aa  165  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 387 aa  165  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.58 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4646  ThiJ/PfpI domain protein  36.12 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0170  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 327 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3952  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.292576  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0075  transcriptional regulator, AraC family  36.97 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 334 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1966  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 329 aa  159  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.327518  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  34.64 
 
 		 317 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 		 322 aa  158  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 		 314 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  35.39 
 
 		 327 aa  155  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 321 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 327 aa  155  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  33.56 
 
 		 319 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  34.92 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  37.1 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 343 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  35.57 
 
 		 369 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 346 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  35.57 
 
 		 374 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 346 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 346 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  35.57 
 
 		 369 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  34.98 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  34.98 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 341 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  30.49 
 
 		 336 aa  152  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 334 aa  152  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 316 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 316 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 316 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 324 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  31.29 
 
 		 372 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  34.98 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2923  transcriptional regulator AraC family  33.23 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283298  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0152  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 318 aa  149  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.143566 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 344 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 363 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 		 327 aa  149  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 331 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  32.71 
 
 		 345 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 344 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 344 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  31.86 
 
 		 341 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  31.76 
 
 		 362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0719  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  36.14 
 
 		 437 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  32.27 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0208  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.76 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0903161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  31.55 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2618  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 339 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 349 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 338 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  31.8 
 
 		 354 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  32.13 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0758  transcriptional regulator  33.23 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.182304  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4876  AraC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  32.01 
 
 		 344 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  30.54 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  32 
 
 		 321 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 336 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>