More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0758 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0758  transcriptional regulator  100 
 
 		 338 aa  664    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.182304  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4300  transcriptional regulator, AraC family  69.58 
 
 		 336 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5056  transcriptional regulator, AraC family  67.89 
 
 		 336 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0278301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2923  transcriptional regulator AraC family  62.62 
 
 		 333 aa  391  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283298  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2618  AraC family transcriptional regulator  64.08 
 
 		 333 aa  378  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3940  AraC family transcriptional regulator  59.44 
 
 		 366 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.15431 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0170  AraC family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 327 aa  292  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0159  transcriptional regulator  47.08 
 
 		 298 aa  264  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2523  AraC family transcriptional regulator  46.06 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0075  transcriptional regulator, AraC family  46.53 
 
 		 307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0094  AraC family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 307 aa  239  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3002  AraC family transcriptional regulator  44.65 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1966  AraC family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.327518  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3952  transcriptional regulator  37.77 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.292576  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1461  transcriptional regulator, AraC family  42.81 
 
 		 331 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2168  transcriptional regulator, AraC family  37.85 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2950  transcriptional regulator, AraC family  34.28 
 
 		 305 aa  162  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  34.16 
 
 		 319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  31.74 
 
 		 354 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  34.98 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 319 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  32.34 
 
 		 358 aa  153  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 346 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.76 
 
 		 338 aa  152  8e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  32.6 
 
 		 344 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4371  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107025  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  36.81 
 
 		 331 aa  149  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 338 aa  149  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  34.46 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  35.26 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  31.15 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  37.09 
 
 		 327 aa  143  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  34.66 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  34.66 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  35.03 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 329 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  37.43 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 310 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 387 aa  139  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  31.87 
 
 		 336 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  31.39 
 
 		 361 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3131  transcription regulator  36.3 
 
 		 303 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  31.17 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  34.67 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  33.87 
 
 		 317 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  34.67 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  34.67 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  31.06 
 
 		 341 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 324 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  33.75 
 
 		 369 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  33.75 
 
 		 369 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  33.74 
 
 		 321 aa  135  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  33.75 
 
 		 374 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  32.82 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  34.36 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  41.12 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3892  transcriptional regulator, AraC family  36.02 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 356 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 334 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  33.44 
 
 		 327 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 322 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 326 aa  132  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 322 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  32.4 
 
 		 362 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 		 338 aa  132  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  32.63 
 
 		 334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  32.63 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>