More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3131 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3131  transcription regulator  100 
 
 		 303 aa  600  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2168  transcriptional regulator, AraC family  61.74 
 
 		 320 aa  355  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4371  transcriptional regulator, AraC family  58.56 
 
 		 307 aa  339  4e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107025  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0339  transcriptional regulator, AraC family  56.76 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2950  transcriptional regulator, AraC family  37.09 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0159  transcriptional regulator  35.57 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0075  transcriptional regulator, AraC family  36.77 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0170  AraC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3952  transcriptional regulator  35.88 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.292576  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0094  AraC family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 307 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  34.64 
 
 		 327 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  36.21 
 
 		 322 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  42.24 
 
 		 317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  34.56 
 
 		 319 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  42.06 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  31.77 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5056  transcriptional regulator, AraC family  34.58 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0278301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1966  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.327518  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 333 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  35.85 
 
 		 321 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0051  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 323 aa  135  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.929929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 319 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  35.6 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  32.77 
 
 		 325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 320 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  35.02 
 
 		 338 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  36.22 
 
 		 338 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  38.67 
 
 		 322 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  37.77 
 
 		 333 aa  132  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 338 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  31.1 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  36.09 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4300  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  36.84 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  32.09 
 
 		 341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  36.84 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  36.09 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  35.31 
 
 		 336 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  36.97 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  33.89 
 
 		 328 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  34.32 
 
 		 317 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  38.53 
 
 		 333 aa  129  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 333 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  34.01 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  36.47 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  32.36 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  31.88 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  36.47 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  33.07 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  36.84 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3002  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  36.62 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 320 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  30.52 
 
 		 333 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  37.55 
 
 		 356 aa  126  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  35.25 
 
 		 331 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  35.25 
 
 		 331 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 330 aa  125  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  34.35 
 
 		 324 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  34.32 
 
 		 362 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  34.33 
 
 		 333 aa  125  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0758  transcriptional regulator  35.39 
 
 		 338 aa  125  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.182304  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 331 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  35.47 
 
 		 318 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  30.13 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  31.29 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  37.34 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  30.29 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  32.89 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  35.47 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  35.34 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  31.82 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  34.72 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  39.42 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  40.67 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  35.09 
 
 		 318 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  35.09 
 
 		 318 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  35.09 
 
 		 318 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  33.45 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2523  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 329 aa  123  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  35.34 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  33.45 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  35.34 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  35.09 
 
 		 318 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 326 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 338 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>