More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2327 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  100 
 
 		 316 aa  661    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  49.52 
 
 		 318 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3186  AraC family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 333 aa  329  3e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  49.04 
 
 		 325 aa  322  4e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0419  arac-family transcriptional regulator  49.53 
 
 		 317 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000111496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0051  transcriptional regulator  46.33 
 
 		 323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.929929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 333 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 350 aa  296  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  45.25 
 
 		 338 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 338 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  43.67 
 
 		 317 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  42.72 
 
 		 317 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 341 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 341 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 333 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 320 aa  271  9e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  41.14 
 
 		 348 aa  266  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 331 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  42.41 
 
 		 331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  42.41 
 
 		 331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 333 aa  258  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  39.3 
 
 		 333 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  43.59 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 335 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 335 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 335 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  39.94 
 
 		 329 aa  248  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  38.46 
 
 		 331 aa  248  7e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  38.73 
 
 		 333 aa  248  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  36.86 
 
 		 333 aa  241  7.999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  37.42 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  42.63 
 
 		 325 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1857  transcriptional regulator, AraC family  39.68 
 
 		 342 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  35.78 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  38.29 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  38.39 
 
 		 333 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  39.35 
 
 		 329 aa  228  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  38.49 
 
 		 347 aa  228  8e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  44.18 
 
 		 350 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  35.56 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  37.54 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  40 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  37.1 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 		 317 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4139  ThiJ/PfpI domain protein  35.9 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  37.11 
 
 		 327 aa  219  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  42.43 
 
 		 328 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2725  transcriptional regulator, AraC family  40.13 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  35.37 
 
 		 318 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  35.69 
 
 		 321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  36.01 
 
 		 321 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  35.62 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  37.42 
 
 		 317 aa  215  8e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  35.05 
 
 		 318 aa  215  9e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  35.05 
 
 		 318 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  35.05 
 
 		 318 aa  215  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  35.05 
 
 		 318 aa  215  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  37.38 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  36.74 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  36.66 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  37.82 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 325 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  37.91 
 
 		 330 aa  212  7.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 346 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  35.58 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  35.67 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  35.92 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  35.92 
 
 		 320 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  35.92 
 
 		 320 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 331 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  39.57 
 
 		 332 aa  209  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1531  transcriptional regulator, AraC family  38.59 
 
 		 316 aa  209  6e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  35.35 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  34.3 
 
 		 333 aa  206  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 316 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 323 aa  206  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  35.28 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  35.92 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  40.59 
 
 		 322 aa  205  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  34.81 
 
 		 339 aa  204  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1760  transcriptional activator FtrA  34.41 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 342 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  33.87 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  35.69 
 
 		 362 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  38.15 
 
 		 327 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  34.94 
 
 		 321 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  37.05 
 
 		 346 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  33.23 
 
 		 326 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  33.23 
 
 		 326 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  34.27 
 
 		 326 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>