More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1966 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1966  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 329 aa  647    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.327518  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3002  AraC family transcriptional regulator  74.84 
 
 		 336 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2523  AraC family transcriptional regulator  71.47 
 
 		 329 aa  457  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1461  transcriptional regulator, AraC family  71.88 
 
 		 331 aa  411  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0170  AraC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0159  transcriptional regulator  43.28 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0094  AraC family transcriptional regulator  44.69 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0075  transcriptional regulator, AraC family  43.48 
 
 		 307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5056  transcriptional regulator, AraC family  41.03 
 
 		 336 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0278301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2923  transcriptional regulator AraC family  41.28 
 
 		 333 aa  212  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283298  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4300  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 336 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2618  AraC family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 333 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0758  transcriptional regulator  43.96 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.182304  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3940  AraC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 366 aa  162  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.15431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2950  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 305 aa  159  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2168  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3952  transcriptional regulator  32.03 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.292576  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4371  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107025  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3131  transcription regulator  34.33 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 346 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  33.75 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  32.19 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  30.72 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  31.41 
 
 		 354 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 322 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 328 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  31.11 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  30.74 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  28.53 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5828  AraC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  37.44 
 
 		 314 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  32.7 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  34.71 
 
 		 342 aa  123  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  31.11 
 
 		 326 aa  122  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 334 aa  122  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  28.53 
 
 		 349 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3892  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  33.54 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  32.79 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  30.94 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  30.94 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1880  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  32.09 
 
 		 338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 		 316 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 338 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 344 aa  119  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.7 
 
 		 338 aa  119  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 361 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  30 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  30.48 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  30.48 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  30.03 
 
 		 339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  30.45 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  31.01 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  34.13 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4646  ThiJ/PfpI domain protein  33.33 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  36.1 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  30.48 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  36.82 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  31.01 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  31.05 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  30.55 
 
 		 312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2164  transcriptional regulator  32.48 
 
 		 340 aa  116  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.0201995 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 321 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 334 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4095  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0719  transcriptional regulator, AraC family  36.45 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  31.94 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4745  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  32.41 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>