More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2641 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  100 
 
 		 322 aa  646    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  79.18 
 
 		 329 aa  518  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  57.05 
 
 		 331 aa  350  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  55.97 
 
 		 321 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  54.49 
 
 		 333 aa  333  2e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  54.95 
 
 		 333 aa  333  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  55.35 
 
 		 321 aa  332  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  53.18 
 
 		 326 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  54.57 
 
 		 318 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  54.57 
 
 		 318 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  54.57 
 
 		 318 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  54.57 
 
 		 318 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  55.73 
 
 		 324 aa  328  7e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  54.57 
 
 		 318 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  56.17 
 
 		 324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  54.26 
 
 		 318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  55.59 
 
 		 333 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  55.41 
 
 		 320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  55.41 
 
 		 320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  56.17 
 
 		 324 aa  325  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  55.1 
 
 		 320 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  53.38 
 
 		 330 aa  325  9e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  56.17 
 
 		 324 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  53.85 
 
 		 321 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  51.58 
 
 		 329 aa  322  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  53.82 
 
 		 333 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  49.03 
 
 		 317 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1760  transcriptional activator FtrA  52.68 
 
 		 318 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  48.24 
 
 		 317 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  49.2 
 
 		 333 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  50.96 
 
 		 328 aa  297  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  50.8 
 
 		 335 aa  296  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  48.73 
 
 		 332 aa  293  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  48.71 
 
 		 326 aa  290  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  50.49 
 
 		 333 aa  289  4e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  49.2 
 
 		 338 aa  288  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  49.2 
 
 		 341 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  49.2 
 
 		 341 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 338 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 330 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 342 aa  286  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  48.73 
 
 		 340 aa  286  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  49.2 
 
 		 333 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  48.71 
 
 		 317 aa  279  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  47 
 
 		 321 aa  277  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 346 aa  273  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  48.06 
 
 		 317 aa  272  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  47.81 
 
 		 350 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  48.58 
 
 		 344 aa  269  5e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  47.15 
 
 		 332 aa  269  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  45.48 
 
 		 348 aa  268  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  48.4 
 
 		 323 aa  265  7e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  46.5 
 
 		 327 aa  261  8e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 320 aa  261  8e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  45.63 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  44.52 
 
 		 334 aa  256  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 326 aa  255  6e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  44.94 
 
 		 356 aa  255  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  45.9 
 
 		 324 aa  251  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 331 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  44.76 
 
 		 331 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  44.76 
 
 		 331 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  43.23 
 
 		 326 aa  248  8e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  43.23 
 
 		 326 aa  248  8e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  43.23 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  48.88 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  48.42 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  45.03 
 
 		 346 aa  246  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 331 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  44.94 
 
 		 347 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  46.03 
 
 		 330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  45.48 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 335 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  43.46 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 335 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  40.32 
 
 		 335 aa  242  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 342 aa  242  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  45.81 
 
 		 325 aa  242  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  41.94 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.13 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  46.18 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  42.72 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  45.71 
 
 		 339 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  44.9 
 
 		 328 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3344  transcriptional regulator, AraC family  44.73 
 
 		 306 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  42.26 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5972  transcriptional regulator, AraC family  41.27 
 
 		 343 aa  239  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 316 aa  238  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 349 aa  238  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  43.91 
 
 		 332 aa  238  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  41.85 
 
 		 334 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  43.27 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 320 aa  236  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3331  transcriptional regulator, AraC family  45.81 
 
 		 348 aa  235  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  45.57 
 
 		 319 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  45.05 
 
 		 320 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>