More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0075 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0075  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 307 aa  622  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0094  AraC family transcriptional regulator  71.19 
 
 		 307 aa  427  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0159  transcriptional regulator  60.34 
 
 		 298 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4300  transcriptional regulator, AraC family  47.71 
 
 		 336 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5056  transcriptional regulator, AraC family  46.71 
 
 		 336 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0278301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2523  AraC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 329 aa  240  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3002  AraC family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 336 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2618  AraC family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 333 aa  232  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0758  transcriptional regulator  46.82 
 
 		 338 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.182304  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1966  AraC family transcriptional regulator  44.01 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.327518  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0170  AraC family transcriptional regulator  40.06 
 
 		 327 aa  226  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2923  transcriptional regulator AraC family  42.81 
 
 		 333 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283298  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3940  AraC family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.15431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1461  transcriptional regulator, AraC family  42.48 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3952  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.292576  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 324 aa  178  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2168  transcriptional regulator, AraC family  38.28 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2950  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 305 aa  165  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3131  transcription regulator  36.77 
 
 		 303 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4371  transcriptional regulator, AraC family  36.95 
 
 		 307 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107025  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  33.12 
 
 		 321 aa  145  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  33.12 
 
 		 344 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  31.6 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 328 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  30.74 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  31.19 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 		 354 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 346 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  30.87 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 333 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 320 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  33.85 
 
 		 321 aa  132  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1009  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 549 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.662069  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  30.19 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  34.08 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 328 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  31.92 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5828  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  32.27 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  32.27 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 338 aa  125  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 331 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  30.74 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0339  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 295 aa  124  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  30.35 
 
 		 372 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  30.84 
 
 		 319 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  30.03 
 
 		 333 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 317 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 		 322 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 326 aa  122  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  31.75 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  32.49 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  31.75 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  30.55 
 
 		 341 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 311 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 321 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 321 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7238  transcriptional regulator  32.9 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402407  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  32.25 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4365  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  31.09 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  29.75 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  31.01 
 
 		 334 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 312 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.99 
 
 		 338 aa  115  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5148  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 328 aa  116  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0642429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 324 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 324 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 351 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  31.72 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  28.3 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3120  AraC family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  33.83 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  33.83 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  30.7 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  33.83 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  33.83 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  33.83 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  33.83 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>