More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5828 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5828  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 312 aa  619  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1009  AraC family transcriptional regulator  65 
 
 		 549 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.662069  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 338 aa  189  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 336 aa  186  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  37.46 
 
 		 338 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  38.06 
 
 		 362 aa  179  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  37.66 
 
 		 327 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40 
 
 		 338 aa  176  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 328 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 324 aa  172  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  37.84 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  37.84 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  35.39 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 338 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  38.06 
 
 		 321 aa  169  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 387 aa  165  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 324 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  35.91 
 
 		 335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  35.64 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  36.3 
 
 		 312 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  40.07 
 
 		 323 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 329 aa  162  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  36.63 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  38.83 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  32.05 
 
 		 325 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  35.57 
 
 		 338 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 334 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  38.8 
 
 		 334 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  43.17 
 
 		 320 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  37.68 
 
 		 334 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  34.77 
 
 		 349 aa  158  9e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  38.28 
 
 		 356 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  35.56 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  36.49 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  35.94 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  34.8 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 357 aa  156  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4095  AraC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4745  AraC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3422  AraC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 319 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  35.83 
 
 		 319 aa  155  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  36.24 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  34.07 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3892  transcriptional regulator, AraC family  38.85 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  37.54 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  38.32 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  34.44 
 
 		 331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 348 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 327 aa  152  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  36.43 
 
 		 328 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  34.12 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 343 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  40.36 
 
 		 369 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 346 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 346 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 346 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 327 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  40.36 
 
 		 369 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  35.69 
 
 		 329 aa  149  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  40.36 
 
 		 374 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4365  AraC family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  35.98 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4646  ThiJ/PfpI domain protein  30.59 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0719  transcriptional regulator, AraC family  34.8 
 
 		 318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 354 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 322 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 363 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 312 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  35.67 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  33.78 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2955  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>