More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4646 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4646  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 		 334 aa  665    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4813  transcriptional regulator, AraC family  55.77 
 
 		 325 aa  317  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0342905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  45.43 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  45.43 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  45.43 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 320 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 322 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 322 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  43.99 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 329 aa  230  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  42.55 
 
 		 334 aa  229  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 387 aa  228  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  40.06 
 
 		 346 aa  225  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  40.56 
 
 		 341 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 338 aa  218  8.999999999999998e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  43.44 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.68 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  40.19 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 		 354 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  40.19 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  42.11 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 357 aa  209  7e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  43.04 
 
 		 338 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  38.26 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  41.96 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  37.08 
 
 		 335 aa  206  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  41.64 
 
 		 369 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  41.64 
 
 		 369 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 343 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  37.36 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 346 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 346 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 346 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  42.9 
 
 		 320 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  39.14 
 
 		 345 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.14 
 
 		 344 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.14 
 
 		 344 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.84 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.84 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.84 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  37.74 
 
 		 319 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 315 aa  199  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  39.55 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  41.08 
 
 		 323 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  39.94 
 
 		 331 aa  195  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  39.14 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  42.66 
 
 		 437 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  39.14 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4876  AraC family transcriptional regulator  44.38 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 321 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 321 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 321 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 321 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 321 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 321 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  34.82 
 
 		 319 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  39.01 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  37.3 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  37.22 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 351 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  36.31 
 
 		 328 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  38.59 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  37.68 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  37.9 
 
 		 332 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  37.93 
 
 		 321 aa  186  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  33.74 
 
 		 372 aa  185  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  41.55 
 
 		 375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  35.42 
 
 		 319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  37.69 
 
 		 342 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2955  AraC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 345 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 334 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  37.54 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 321 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 321 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 321 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  36.81 
 
 		 339 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 317 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  34.37 
 
 		 362 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  35.13 
 
 		 341 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  37.3 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>