292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4150 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4150  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 		 191 aa  397  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4431  ThiJ/PfpI domain protein  95.29 
 
 		 191 aa  380  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0065  ThiJ/PfpI domain protein  85.34 
 
 		 191 aa  345  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0083  ThiJ/PfpI domain protein  82.54 
 
 		 195 aa  330  7.000000000000001e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1314  ThiJ/PfpI domain-containing protein  64.67 
 
 		 185 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.02067e-17 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2477  ThiJ/PfpI domain-containing protein  66.12 
 
 		 185 aa  248  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2085  ThiJ/PfpI domain protein  64.67 
 
 		 185 aa  248  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1190  ThiJ/PfpI domain protein  64.67 
 
 		 185 aa  248  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00457983  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2146  ThiJ/PfpI domain-containing protein  64.13 
 
 		 185 aa  248  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.21104e-22 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2091  ThiJ/PfpI domain protein  62.78 
 
 		 180 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.616699  hitchhiker  3.51942e-22 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0928  DJ-1/PfpI family protein  47.59 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0981  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.59 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3363  ThiJ/PfpI-family thiamine biogenesis protein  47.06 
 
 		 192 aa  174  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0640  putative 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  32.74 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00127997  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2034  DJ-1 family protein  41.95 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2354  DJ-1 family protein  36.99 
 
 		 184 aa  107  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0457203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0371  DJ-1 family protein  34.81 
 
 		 181 aa  104  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00995133  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0481  DJ-1 family protein  38.15 
 
 		 183 aa  104  8e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.476054  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11290  DJ-1 family protein  33.93 
 
 		 181 aa  101  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000017657  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2774  DJ-1 family protein  36.69 
 
 		 202 aa  98.6  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0509  DJ-1 family protein  36.26 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0833  DJ-1 family protein  35.29 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2890  DJ-1 family protein  33.33 
 
 		 196 aa  94.7  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0634  ThiJ/PfpI family protein  33.72 
 
 		 181 aa  93.6  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.403728 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  34.1 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0941  protein ThiJ  30.98 
 
 		 196 aa  94.4  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.963617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2038  DJ-1 family protein  32.56 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3277  DJ-1 family protein  32.26 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2324  DJ-1 family protein  31.98 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  32.22 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1057  DJ-1 family protein  32.61 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000197778  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1034  DJ-1 family protein  32.26 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463185  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4036  DJ-1 family protein  31.95 
 
 		 183 aa  92.8  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1245  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  36.26 
 
 		 179 aa  92  5e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3107  DJ-1 family protein  33.33 
 
 		 196 aa  91.7  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3249  DJ-1 family protein  33.33 
 
 		 196 aa  91.7  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3081  DJ-1 family protein  31.18 
 
 		 198 aa  91.3  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.713776  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1780  DJ-1  34.27 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0510  DJ-1 family protein  33.33 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.000981591  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0966  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  31.58 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000883438  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1009  DJ-1 family protein  31.49 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047613  normal  0.605199 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  32.34 
 
 		 388 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3069  DJ-1 family protein  33.33 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0891  DJ-1 family protein  31.67 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4895  DJ-1  31.11 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  30.94 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002695  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazol monophosphate biosynthesis enzyme  31.25 
 
 		 199 aa  86.3  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03289  hypothetical protein  31.25 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1215  DJ-1  33.33 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1082  DJ-1 family protein  29.57 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871553 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1845  putative protease  30.29 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2566  DJ-1 family protein  32.58 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.290389  normal  0.0127226 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1208  DJ-1 family protein  32.96 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1238  4-methyl-5(beta-hydroxyethyl)-thiazol monophosphate biosynthesis protein-like  34.83 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1895  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  26.74 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0832  DJ-1 family protein  30.36 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0233882 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1633  protein ThiJ  31.58 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0029  DJ-1  33.73 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0843  ThiJ/PfpI domain protein  28.26 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3185  DJ-1 family protein  29.44 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0326  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  31.28 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000260198  hitchhiker  6.98835e-17 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2019  DJ-1 family protein  32.75 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.236764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3209  DJ-1 family protein  29.44 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000549408 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00372  hypothetical protein  29.44 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0456  DJ-1 family protein  29.44 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0346  DJ-1 family protein  29.44 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0508  DJ-1 family protein  29.44 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0496  DJ-1 family protein  29.44 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0460  DJ-1 family protein  29.44 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00376  hypothetical protein  29.44 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0681  DJ-1 family protein  28.49 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728078  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0523  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  28.49 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017348  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1118  DJ-1 family protein  28.07 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3874  DJ-1 family protein  29.89 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  30.99 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl263  putative intracellular protease/amidase  29.38 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.04249e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0978  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  31.07 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0914  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  30.51 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1523  DJ-1 family protein  32.56 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0118  DJ-1 family protein  29.19 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2500  DJ-1 family protein  32.67 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0133891  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_127  DJ-1, 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  29.19 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0908  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  30.51 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0472  DJ-1 family protein  30.56 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  32.9 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0251  DJ-1 family protein  29.19 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0894  4-methyl-5(beta-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate synthesis protein  29.9 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.022908  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0535  DJ-1 family protein  30.56 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0474  DJ-1 family protein  30.56 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0623  DJ-1 family protein  30.41 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.226753  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  31.61 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32791  predicted protein  29.94 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0480  DJ-1 family protein  30 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.757447  normal  0.338171 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  31.61 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0493  DJ-1 family protein  30.56 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3290  DJ-1 family protein  27.93 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  35.07 
 
 		 261 aa  68.2  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4496  peptidase C56, PfpI  30.37 
 
 		 364 aa  67  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  26.49 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  32.05 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>