More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2184 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2184  rubrerythrin  100 
 
 
243 aa  504  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2533  rubrerythrin  80.59 
 
 
237 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28841  rubredoxin:rubrerythrin:rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  75.65 
 
 
235 aa  367  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1649  rubrerythrin  69.96 
 
 
238 aa  337  9.999999999999999e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429351 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1511  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  67.95 
 
 
237 aa  332  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1538  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  67.95 
 
 
237 aa  332  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.029752 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  64.47 
 
 
237 aa  300  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1537  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.04 
 
 
237 aa  298  5e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0402296  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0679  Rubrerythrin  44.05 
 
 
164 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0090  rubrerythrin  43.67 
 
 
160 aa  118  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4854  rubrerythrin  42.26 
 
 
165 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.836415  normal  0.0724585 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2317  rubrerythrin/nigerythrin-like protein  44.72 
 
 
157 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.761634 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1376  rubrerythrin  42.77 
 
 
161 aa  111  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.642256  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  39.27 
 
 
167 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  36.76 
 
 
164 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0296  rubrerythrin  37.58 
 
 
143 aa  95.5  7e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.585668 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  32.27 
 
 
166 aa  94  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  33.78 
 
 
165 aa  93.6  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  41.36 
 
 
140 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  34.86 
 
 
178 aa  92.4  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  40.24 
 
 
168 aa  91.7  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  33.78 
 
 
168 aa  91.7  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  33.78 
 
 
165 aa  90.9  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  32.87 
 
 
165 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  37.77 
 
 
215 aa  90.5  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  32.31 
 
 
177 aa  90.5  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  36.75 
 
 
144 aa  90.1  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  40 
 
 
140 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  89.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  40 
 
 
140 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  40 
 
 
140 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  33.33 
 
 
165 aa  89.7  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  39.02 
 
 
139 aa  89.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  32.87 
 
 
158 aa  89.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0217  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.71 
 
 
58 aa  89.4  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  39.16 
 
 
140 aa  89.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0059  rubrerythrin  35.84 
 
 
156 aa  89  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0465733  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  37.3 
 
 
166 aa  89  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  32.41 
 
 
165 aa  89  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  32.58 
 
 
166 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  36.76 
 
 
166 aa  88.6  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  42.07 
 
 
140 aa  87.8  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  35.6 
 
 
179 aa  87.8  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  39.16 
 
 
139 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  35.75 
 
 
183 aa  88.2  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  32.27 
 
 
166 aa  88.2  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  35.75 
 
 
183 aa  87.4  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  32.42 
 
 
164 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  35.75 
 
 
183 aa  87.4  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  33.18 
 
 
165 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  37.2 
 
 
139 aa  87.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  30.91 
 
 
166 aa  87.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  32.13 
 
 
166 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  39.39 
 
 
140 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  40 
 
 
140 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  39.62 
 
 
140 aa  86.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  32.02 
 
 
233 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  33.48 
 
 
166 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  31.98 
 
 
166 aa  85.9  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0899  Rubrerythrin  41.18 
 
 
144 aa  85.9  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  33.51 
 
 
178 aa  85.9  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  31.96 
 
 
178 aa  85.9  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  34.39 
 
 
165 aa  85.9  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  35.75 
 
 
179 aa  85.5  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  33.33 
 
 
166 aa  85.5  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  33.79 
 
 
164 aa  85.5  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  31.67 
 
 
166 aa  85.5  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  41.4 
 
 
140 aa  85.1  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  33.18 
 
 
165 aa  85.1  9e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  38.55 
 
 
139 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  32.09 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  39.38 
 
 
146 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  40 
 
 
146 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  31.78 
 
 
179 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  32.8 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1978  rubredoxin-like  56.86 
 
 
76 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000953598  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  32 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  40.88 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  40.88 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  40.88 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  31.31 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  38.18 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.75 
 
 
60 aa  82  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232754  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  31.66 
 
 
166 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  30.37 
 
 
164 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  40.12 
 
 
140 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  31.53 
 
 
166 aa  81.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0270  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  69.57 
 
 
53 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460906  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  31.08 
 
 
166 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0272  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  69.57 
 
 
53 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000689971  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  32.95 
 
 
166 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  32.61 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.430774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>