299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0900 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0900  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 		 57 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837679 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1135  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  85.96 
 
 		 57 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74035  normal  0.399177 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3022  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  82.46 
 
 		 57 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3173  rubredoxin  88.68 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.665694  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0668  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  88.68 
 
 		 64 aa  103  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00929106  normal  0.799564 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0752  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  88.68 
 
 		 70 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.765216  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0380  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  88.68 
 
 		 70 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0735  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  88.68 
 
 		 70 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.026428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0862  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  88.68 
 
 		 70 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1999  rubredoxin  88.68 
 
 		 56 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3960  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  88.68 
 
 		 56 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.326479 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3115  rubredoxin  88.68 
 
 		 56 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0914  rubredoxin  88.68 
 
 		 56 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1460  rubredoxin  88.68 
 
 		 56 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2330  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  88.68 
 
 		 56 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0569406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0833  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  88.68 
 
 		 56 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0206003  hitchhiker  0.0000319456 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2744  rubredoxin  88.68 
 
 		 56 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3151  rubredoxin  88.68 
 
 		 56 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.305413  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2624  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  86.79 
 
 		 56 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3813  rubredoxin  86.79 
 
 		 56 aa  100  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2526  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  86.79 
 
 		 56 aa  100  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105368 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2902  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  92 
 
 		 50 aa  100  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.152091  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3355  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  80.7 
 
 		 57 aa  100  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.862516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3579  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  92 
 
 		 50 aa  100  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0406077 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0667  rubredoxin protein  84.91 
 
 		 60 aa  100  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  84.91 
 
 		 60 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.319433  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0611  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  84.91 
 
 		 60 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0866  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  84.91 
 
 		 56 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0534026  normal  0.223756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4627  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  81.82 
 
 		 56 aa  97.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529245  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0238  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  83.02 
 
 		 56 aa  97.4  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.24657  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3191  rubredoxin  88 
 
 		 50 aa  96.3  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.423634  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0260  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  81.13 
 
 		 56 aa  96.7  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1571  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  89.58 
 
 		 48 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257235 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3972  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  84 
 
 		 50 aa  95.1  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0125725 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2626  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  77.36 
 
 		 65 aa  94  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3687  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  81.13 
 
 		 59 aa  94  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484857  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1370  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  80 
 
 		 50 aa  90.1  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0104809  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2554  rubredoxin protein  71.7 
 
 		 60 aa  88.2  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5371  rubredoxin/rubredoxin reductase  66.04 
 
 		 461 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2316  rubredoxin  67.92 
 
 		 56 aa  85.5  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3710  putative rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  67.92 
 
 		 179 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02387  hypothetical protein  67.92 
 
 		 70 aa  85.1  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3286  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.5 
 
 		 63 aa  84  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552771  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1492  hypothetical protein  66.67 
 
 		 58 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1491  hypothetical protein  66.67 
 
 		 58 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62 
 
 		 480 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2418  RubB protein  66.04 
 
 		 55 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1253  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  67.92 
 
 		 54 aa  82  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698268  hitchhiker  0.00824609 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7086  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.64 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7103  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  65.45 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0605  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  69.81 
 
 		 54 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0064851  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0091  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66.04 
 
 		 54 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94635  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4855  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.26 
 
 		 54 aa  80.1  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.802626  normal  0.0694189 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1190  putative rubredoxin protein  62.26 
 
 		 54 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0111  rubredoxin  66.04 
 
 		 57 aa  79.3  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0205  RubA  61.82 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1200  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.26 
 
 		 54 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.196829  normal  0.959645 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6897  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.15 
 
 		 56 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3952  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.15 
 
 		 61 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.336788 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0680  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.15 
 
 		 56 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001294  rubredoxin-NAD(+) reductase  60.38 
 
 		 477 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.956005  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2068  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.38 
 
 		 56 aa  79.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190541 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2083  rubredoxin  66.04 
 
 		 57 aa  79.3  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3592  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.15 
 
 		 55 aa  78.2  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4719  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.65 
 
 		 60 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.378789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0158  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.15 
 
 		 55 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5315  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.15 
 
 		 55 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5224  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.15 
 
 		 55 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.573132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  64.15 
 
 		 55 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4403  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.38 
 
 		 55 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.162271 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1377  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.38 
 
 		 55 aa  77.4  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.320132  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  66.04 
 
 		 62 aa  77.4  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1744  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.89 
 
 		 60 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3672  rubredoxin  65.31 
 
 		 57 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0197  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62.26 
 
 		 55 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.492346 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13279  rubredoxin rubB  57.89 
 
 		 60 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.610704  normal  0.724934 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3629  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.49 
 
 		 64 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1352  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60 
 
 		 59 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.726116 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6127  rubredoxin  58.49 
 
 		 55 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.62 
 
 		 55 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.552989  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70630  rubredoxin 2  58.49 
 
 		 55 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2173  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56 
 
 		 415 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.953962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6128  rubredoxin 1  62.26 
 
 		 55 aa  74.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70640  rubredoxin 1  62.26 
 
 		 55 aa  74.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0916  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.63 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.537464  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2748  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  60.38 
 
 		 62 aa  73.6  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3447  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.72 
 
 		 58 aa  72  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5602  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.49 
 
 		 55 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5702  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.88 
 
 		 60 aa  72  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0937  rubredoxin-related protein  56.6 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.198839  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5029  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.6 
 
 		 55 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.651986  normal  0.30239 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54 
 
 		 476 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0788  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  62 
 
 		 56 aa  72  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2089  rubredoxin  52.63 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  50.91 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0691  rubredoxin  52.63 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1134  rubredoxin  52.63 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1142  rubredoxin  52.63 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2523  rubredoxin  52.63 
 
 		 60 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2205  rubredoxin  52.63 
 
 		 60 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>