23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2117 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2117  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 		 111 aa  232  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0063  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.96 
 
 		 111 aa  157  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1259  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.44 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.790235 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0077  rubredoxin/rubrerythrin  67.57 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.165154  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2955  rubredoxin/rubrerythrin  64.86 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00806345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0099  rubrerythrin  64.86 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0220347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2638  rubrerythrin  64.1 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000156836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0681  rubredoxin/rubrerythrin  69.7 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0682  rubredoxin/rubrerythrin  72.73 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3816  rubrerythrin  63.64 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4567  Rubrerythrin  57.89 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.02567e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.1 
 
 		 216 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0081  rubrerythrin  51.35 
 
 		 181 aa  47.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1529  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.41 
 
 		 209 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00138894  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0588  rubrerythrin  55.56 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0902  Rubrerythrin  47.22 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197939  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3505  rubrerythrin  58.06 
 
 		 180 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000134331  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  39.39 
 
 		 884 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3363  hypothetical protein  45.45 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3241  hypothetical protein  47.06 
 
 		 36 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000312443  hitchhiker  0.0015976 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  52.78 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2460  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase or nitrite reductase  56 
 
 		 501 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000440664  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0238  hypothetical protein  43.9 
 
 		 47 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>