50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3241 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3241  hypothetical protein  100 
 
 		 36 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000312443  hitchhiker  0.0015976 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2460  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase or nitrite reductase  71.88 
 
 		 501 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000440664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  70.59 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  58.82 
 
 		 884 aa  61.6  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1529  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.14 
 
 		 209 aa  57  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00138894  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.06 
 
 		 520 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  57.14 
 
 		 878 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  57.14 
 
 		 878 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3816  rubrerythrin  55.88 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0077  rubredoxin/rubrerythrin  61.76 
 
 		 180 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.165154  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2955  rubredoxin/rubrerythrin  62.5 
 
 		 180 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00806345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0099  rubrerythrin  62.5 
 
 		 180 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0220347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0682  rubredoxin/rubrerythrin  61.76 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2638  rubrerythrin  61.76 
 
 		 188 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000156836  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0588  rubrerythrin  58.82 
 
 		 181 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0681  rubredoxin/rubrerythrin  52.94 
 
 		 180 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  54.84 
 
 		 233 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  56.67 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  51.61 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4567  Rubrerythrin  59.38 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.02567e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0063  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.58 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  50 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  48.39 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  50 
 
 		 190 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  50 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  53.33 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  44.12 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2454  rubredoxin  58.06 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1124  flavin reductase domain protein FMN-binding  54.29 
 
 		 236 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.373521  hitchhiker  0.0000000875399 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2935  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.51 
 
 		 53 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  48.39 
 
 		 179 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  53.33 
 
 		 191 aa  41.6  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  48.39 
 
 		 177 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0907  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.67 
 
 		 163 aa  41.6  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000583503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  53.33 
 
 		 191 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0081  rubrerythrin  47.06 
 
 		 181 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3363  hypothetical protein  44.12 
 
 		 83 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  53.33 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  46.67 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1856  ruberythrin-like  41.67 
 
 		 39 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406851  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  59.09 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  59.26 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  51.52 
 
 		 194 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2117  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.06 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  50 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  50 
 
 		 190 aa  40.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  50 
 
 		 191 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  50 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  48.39 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3505  rubrerythrin  47.22 
 
 		 180 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000134331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>