74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0681 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0681  rubredoxin/rubrerythrin  100 
 
 		 180 aa  366  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0682  rubredoxin/rubrerythrin  97.78 
 
 		 180 aa  362  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0099  rubrerythrin  93.33 
 
 		 180 aa  347  6e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0220347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2955  rubredoxin/rubrerythrin  93.33 
 
 		 180 aa  347  6e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00806345  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0077  rubredoxin/rubrerythrin  93.33 
 
 		 180 aa  346  9e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.165154  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2638  rubrerythrin  93.33 
 
 		 188 aa  346  1e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000156836  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0588  rubrerythrin  76.8 
 
 		 181 aa  292  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4567  Rubrerythrin  78.89 
 
 		 181 aa  291  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.02567e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3505  rubrerythrin  77.22 
 
 		 180 aa  290  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000134331  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0081  rubrerythrin  72.07 
 
 		 181 aa  281  4.0000000000000003e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3816  rubrerythrin  67.22 
 
 		 180 aa  250  8.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0902  Rubrerythrin  72.38 
 
 		 181 aa  249  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1879  rubrerythrin  52.59 
 
 		 140 aa  130  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000143668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15600  Rubrerythrin  47.92 
 
 		 141 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0954  rubrerythrin  55.47 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1532  rubrerythrin  49.65 
 
 		 139 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0387  rubrerythrin  50.7 
 
 		 139 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.424409 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0449  rubrerythrin  50.7 
 
 		 139 aa  127  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0458  rubrerythrin  48.23 
 
 		 139 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.79007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2476  rubrerythrin  46.81 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000982174  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1108  Rubrerythrin  46.98 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.666656  normal  0.376082 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2434  rubrerythrin  42.74 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1596  hypothetical protein  41.18 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2117  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  69.7 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0063  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.21 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  34.38 
 
 		 392 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  60 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.43 
 
 		 520 aa  53.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  60 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  30.5 
 
 		 696 aa  51.2  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  66.67 
 
 		 169 aa  51.2  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  28.57 
 
 		 696 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  70.83 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1529  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.06 
 
 		 209 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00138894  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2460  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase or nitrite reductase  45.65 
 
 		 501 aa  48.9  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000440664  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  29.32 
 
 		 221 aa  48.5  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  60.61 
 
 		 169 aa  48.5  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3241  hypothetical protein  52.94 
 
 		 36 aa  47.8  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000312443  hitchhiker  0.0015976 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  62.07 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  54.84 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  24.82 
 
 		 161 aa  45.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  45.45 
 
 		 878 aa  44.7  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  45.45 
 
 		 878 aa  44.7  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  36.99 
 
 		 168 aa  44.7  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1197  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.38 
 
 		 52 aa  44.7  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  54.55 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  28.21 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  60 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  24.82 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  58.62 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1259  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.71 
 
 		 109 aa  43.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.790235 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  28.69 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  46.67 
 
 		 884 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0436  hypothetical protein  55.88 
 
 		 802 aa  42.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  26.81 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  43.75 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  36.62 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  60.71 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000223416  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0414  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.46 
 
 		 52 aa  42  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1125  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.18 
 
 		 53 aa  42.4  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.228048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  28.57 
 
 		 139 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  60.87 
 
 		 178 aa  42  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  28.57 
 
 		 139 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  60.87 
 
 		 178 aa  42  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  28.57 
 
 		 139 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  36.84 
 
 		 166 aa  42  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  48.57 
 
 		 170 aa  41.6  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  29.41 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  29.69 
 
 		 140 aa  41.2  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2234  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.61 
 
 		 221 aa  41.2  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000004842  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1856  ruberythrin-like  39.39 
 
 		 39 aa  41.2  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406851  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  48.57 
 
 		 170 aa  41.2  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  35.62 
 
 		 164 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  48.57 
 
 		 170 aa  41.2  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>