71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4567 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4567  Rubrerythrin  100 
 
 		 181 aa  371  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.02567e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0588  rubrerythrin  81.22 
 
 		 181 aa  311  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0099  rubrerythrin  81.77 
 
 		 180 aa  302  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0220347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2955  rubredoxin/rubrerythrin  81.77 
 
 		 180 aa  302  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00806345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2638  rubrerythrin  81.77 
 
 		 188 aa  302  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000156836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0077  rubredoxin/rubrerythrin  80.66 
 
 		 180 aa  300  5.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.165154  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0682  rubredoxin/rubrerythrin  80.56 
 
 		 180 aa  294  4e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0681  rubredoxin/rubrerythrin  78.89 
 
 		 180 aa  291  5e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3505  rubrerythrin  75.56 
 
 		 180 aa  287  7e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000134331  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0902  Rubrerythrin  78.45 
 
 		 181 aa  275  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197939  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0081  rubrerythrin  72.22 
 
 		 181 aa  273  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3816  rubrerythrin  67.96 
 
 		 180 aa  253  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477508  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0387  rubrerythrin  52.82 
 
 		 139 aa  138  3e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.424409 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0449  rubrerythrin  52.82 
 
 		 139 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1532  rubrerythrin  52.11 
 
 		 139 aa  137  6e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0954  rubrerythrin  54.93 
 
 		 140 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1879  rubrerythrin  54.41 
 
 		 140 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000143668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0458  rubrerythrin  49.3 
 
 		 139 aa  131  6e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.79007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15600  Rubrerythrin  48.94 
 
 		 141 aa  127  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2476  rubrerythrin  46.1 
 
 		 140 aa  121  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000982174  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1108  Rubrerythrin  50.74 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.666656  normal  0.376082 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2434  rubrerythrin  45.3 
 
 		 124 aa  84.3  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1596  hypothetical protein  43.44 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0063  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34 
 
 		 111 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2117  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.89 
 
 		 111 aa  52.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  29.46 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  30 
 
 		 696 aa  48.9  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  30.08 
 
 		 392 aa  48.5  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  36.78 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  28.04 
 
 		 696 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  36.36 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  36.14 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  35.63 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  29.91 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1277  bacterioferritin  28.91 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  38.96 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  37.04 
 
 		 884 aa  45.1  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  29.06 
 
 		 178 aa  45.1  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3241  hypothetical protein  59.38 
 
 		 36 aa  45.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000312443  hitchhiker  0.0015976 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  35.06 
 
 		 166 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1529  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.59 
 
 		 209 aa  45.1  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00138894  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  58.62 
 
 		 216 aa  44.7  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  35.63 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.28 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  50 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  26.32 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  35.9 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  57.58 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0296  rubrerythrin  29.13 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.585668 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  36.99 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  35.06 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  63.64 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  29.27 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2234  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.61 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000004842  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  36.99 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000223416  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  46.15 
 
 		 878 aa  42  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  46.15 
 
 		 878 aa  42  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  30.43 
 
 		 159 aa  42  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  32.91 
 
 		 165 aa  42.4  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  51.61 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  54.55 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  28.91 
 
 		 140 aa  41.6  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  55.17 
 
 		 183 aa  41.2  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  53.33 
 
 		 178 aa  41.2  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  30.77 
 
 		 179 aa  41.2  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  53.33 
 
 		 178 aa  41.2  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  55.17 
 
 		 183 aa  41.2  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  55.17 
 
 		 183 aa  41.2  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0982  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.39 
 
 		 326 aa  41.2  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0152771  normal  0.420288 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  34.25 
 
 		 164 aa  41.2  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  35.09 
 
 		 161 aa  40.8  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>