91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1108 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1108  Rubrerythrin  100 
 
 
143 aa  289  9e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.666656  normal  0.376082 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15600  Rubrerythrin  60.29 
 
 
141 aa  158  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1879  rubrerythrin  58.09 
 
 
140 aa  157  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000143668  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2476  rubrerythrin  57.35 
 
 
140 aa  155  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000982174  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0458  rubrerythrin  54.74 
 
 
139 aa  155  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.79007  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0387  rubrerythrin  55.88 
 
 
139 aa  154  6e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.424409 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0954  rubrerythrin  57.75 
 
 
140 aa  153  9e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0449  rubrerythrin  55.88 
 
 
139 aa  152  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1532  rubrerythrin  55.15 
 
 
139 aa  150  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4567  Rubrerythrin  50.74 
 
 
181 aa  121  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.02567e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0588  rubrerythrin  49.26 
 
 
181 aa  120  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2638  rubrerythrin  48.57 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000156836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2955  rubredoxin/rubrerythrin  48.57 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00806345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0099  rubrerythrin  48.57 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0220347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0682  rubredoxin/rubrerythrin  47.65 
 
 
180 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0077  rubredoxin/rubrerythrin  47.86 
 
 
180 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.165154  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0681  rubredoxin/rubrerythrin  46.98 
 
 
180 aa  117  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0081  rubrerythrin  48.33 
 
 
181 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3505  rubrerythrin  45.71 
 
 
180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000134331  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3816  rubrerythrin  43.57 
 
 
180 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477508  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2434  rubrerythrin  46.28 
 
 
124 aa  104  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1596  hypothetical protein  44.17 
 
 
127 aa  93.6  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0902  Rubrerythrin  47.79 
 
 
181 aa  92.8  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197939  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  33.33 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  32.09 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  33.33 
 
 
166 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  33.63 
 
 
166 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  31.65 
 
 
144 aa  50.1  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  31.25 
 
 
166 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  35.38 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  33.63 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0296  rubrerythrin  31.16 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.585668 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  31.25 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  32.74 
 
 
166 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  30.77 
 
 
139 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  41.18 
 
 
164 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  41.18 
 
 
166 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  36.36 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  28.78 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  28.78 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  27.41 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  33.33 
 
 
166 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  33.05 
 
 
164 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  30.97 
 
 
192 aa  45.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  29.82 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  31.53 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  29.03 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  33.33 
 
 
166 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  30.77 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  32.08 
 
 
166 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  34.17 
 
 
163 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  32.99 
 
 
191 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  39.71 
 
 
166 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  29.29 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  38.24 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  29.29 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  33.06 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  29.29 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  34.18 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  30.65 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  27.82 
 
 
233 aa  42.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  39.24 
 
 
177 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  29.29 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  29.29 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  29.29 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  29.29 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  29.29 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  38.24 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1247  Rubrerythrin  30.58 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0899  Rubrerythrin  29.29 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  29.73 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  33.94 
 
 
164 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  38.57 
 
 
191 aa  41.6  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  29.69 
 
 
139 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  29.29 
 
 
140 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  30.71 
 
 
140 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  31.52 
 
 
191 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  37.14 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  30.09 
 
 
179 aa  41.2  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  30.95 
 
 
179 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  30.09 
 
 
192 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  39.24 
 
 
179 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  38.24 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  29.03 
 
 
164 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958071  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  29.41 
 
 
168 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  41.67 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  28.57 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  36.76 
 
 
167 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  35.29 
 
 
179 aa  40  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  35.29 
 
 
179 aa  40  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  30.16 
 
 
178 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>