64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0902 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0902  Rubrerythrin  100 
 
 
181 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0588  rubrerythrin  77.35 
 
 
181 aa  293  8e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4567  Rubrerythrin  78.45 
 
 
181 aa  293  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.02567e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2638  rubrerythrin  73.48 
 
 
188 aa  273  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000156836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2955  rubredoxin/rubrerythrin  73.48 
 
 
180 aa  273  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00806345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0099  rubrerythrin  73.48 
 
 
180 aa  273  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0220347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0077  rubredoxin/rubrerythrin  72.38 
 
 
180 aa  271  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.165154  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0681  rubredoxin/rubrerythrin  72.38 
 
 
180 aa  267  7e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3505  rubrerythrin  71.67 
 
 
180 aa  266  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000134331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0682  rubredoxin/rubrerythrin  71.27 
 
 
180 aa  265  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0081  rubrerythrin  68.33 
 
 
181 aa  259  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3816  rubrerythrin  68.51 
 
 
180 aa  248  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477508  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0449  rubrerythrin  51.06 
 
 
139 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1532  rubrerythrin  49.65 
 
 
139 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0387  rubrerythrin  51.06 
 
 
139 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.424409 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1879  rubrerythrin  52.59 
 
 
140 aa  127  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000143668  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0954  rubrerythrin  51.77 
 
 
140 aa  124  5e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0458  rubrerythrin  48.55 
 
 
139 aa  124  9e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.79007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15600  Rubrerythrin  52.07 
 
 
141 aa  121  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2476  rubrerythrin  48.53 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000982174  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1108  Rubrerythrin  47.79 
 
 
143 aa  101  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.666656  normal  0.376082 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2434  rubrerythrin  43.59 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1596  hypothetical protein  41.8 
 
 
127 aa  77  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  33.83 
 
 
392 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  28.49 
 
 
696 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  27.42 
 
 
696 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0063  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  30.63 
 
 
111 aa  52.4  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1529  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.63 
 
 
209 aa  52.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00138894  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2234  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.84 
 
 
221 aa  48.9  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000004842  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  50 
 
 
168 aa  48.1  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 
520 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  29.51 
 
 
178 aa  46.2  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  56.67 
 
 
178 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  56.67 
 
 
178 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  53.33 
 
 
884 aa  45.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2117  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.22 
 
 
111 aa  45.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  53.33 
 
 
194 aa  45.1  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  30.83 
 
 
221 aa  45.1  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  55.17 
 
 
215 aa  45.1  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  48.39 
 
 
180 aa  44.7  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  41.33 
 
 
166 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  57.58 
 
 
169 aa  44.7  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  55.17 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  58.62 
 
 
214 aa  43.5  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  36.78 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  26.81 
 
 
196 aa  43.9  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  55.17 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  55.17 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  54.55 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  59.26 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  41.33 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  36.36 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  42.67 
 
 
166 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  36.36 
 
 
164 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  35.53 
 
 
168 aa  42.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  39.39 
 
 
166 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  28.06 
 
 
197 aa  42  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  50 
 
 
177 aa  42  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  48.39 
 
 
185 aa  41.6  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  42.42 
 
 
179 aa  41.6  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  59.26 
 
 
191 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  53.33 
 
 
179 aa  41.6  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  53.33 
 
 
191 aa  41.2  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  34.29 
 
 
164 aa  40.8  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>