47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3505 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3505  rubrerythrin  100 
 
 		 180 aa  370  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000134331  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0588  rubrerythrin  79.44 
 
 		 181 aa  304  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0681  rubredoxin/rubrerythrin  77.22 
 
 		 180 aa  290  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0682  rubredoxin/rubrerythrin  77.22 
 
 		 180 aa  289  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4567  Rubrerythrin  75.56 
 
 		 181 aa  287  6e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.02567e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2955  rubredoxin/rubrerythrin  76.67 
 
 		 180 aa  285  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00806345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0099  rubrerythrin  76.67 
 
 		 180 aa  285  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0220347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2638  rubrerythrin  76.67 
 
 		 188 aa  285  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000156836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0077  rubredoxin/rubrerythrin  76.11 
 
 		 180 aa  284  4e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.165154  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0081  rubrerythrin  68.33 
 
 		 181 aa  259  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0902  Rubrerythrin  71.67 
 
 		 181 aa  249  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197939  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3816  rubrerythrin  62.22 
 
 		 180 aa  231  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477508  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1879  rubrerythrin  50.75 
 
 		 140 aa  124  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000143668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1532  rubrerythrin  48.23 
 
 		 139 aa  124  7e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0387  rubrerythrin  48.94 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.424409 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15600  Rubrerythrin  46.1 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0449  rubrerythrin  48.94 
 
 		 139 aa  123  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0954  rubrerythrin  51.06 
 
 		 140 aa  121  5e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0458  rubrerythrin  46.1 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.79007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2476  rubrerythrin  47.06 
 
 		 140 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000982174  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1108  Rubrerythrin  45.71 
 
 		 143 aa  105  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.666656  normal  0.376082 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2434  rubrerythrin  46.15 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1596  hypothetical protein  41.32 
 
 		 127 aa  70.5  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50 
 
 		 520 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  30.88 
 
 		 221 aa  50.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  28.04 
 
 		 392 aa  48.5  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  29.93 
 
 		 696 aa  48.1  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  29.93 
 
 		 696 aa  48.1  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0063  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  33.66 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  25.55 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  30.51 
 
 		 178 aa  45.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2117  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  58.06 
 
 		 111 aa  45.1  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.94 
 
 		 216 aa  44.7  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  27.07 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  51.72 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  31.97 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  24.82 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  29.06 
 
 		 178 aa  41.6  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0296  rubrerythrin  45.28 
 
 		 143 aa  41.6  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.585668 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3363  hypothetical protein  46.88 
 
 		 83 aa  41.6  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  30.16 
 
 		 139 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  30.16 
 
 		 139 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  30.16 
 
 		 139 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  33.33 
 
 		 182 aa  40.8  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2460  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase or nitrite reductase  40.74 
 
 		 501 aa  40.8  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000440664  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1529  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.45 
 
 		 209 aa  40.8  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00138894  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  62.5 
 
 		 172 aa  40.8  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>