90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0387 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0387  rubrerythrin  100 
 
 
139 aa  276  6e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.424409 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0449  rubrerythrin  98.56 
 
 
139 aa  275  2e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1532  rubrerythrin  97.12 
 
 
139 aa  270  5.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0458  rubrerythrin  84.89 
 
 
139 aa  239  9e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.79007  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0954  rubrerythrin  76.98 
 
 
140 aa  205  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2476  rubrerythrin  57.97 
 
 
140 aa  167  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000982174  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1879  rubrerythrin  60.14 
 
 
140 aa  166  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000143668  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15600  Rubrerythrin  56.52 
 
 
141 aa  154  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1108  Rubrerythrin  55.88 
 
 
143 aa  143  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.666656  normal  0.376082 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4567  Rubrerythrin  52.82 
 
 
181 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.02567e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0588  rubrerythrin  52.11 
 
 
181 aa  134  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2638  rubrerythrin  51.75 
 
 
188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000156836  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0099  rubrerythrin  51.75 
 
 
180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0220347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2955  rubredoxin/rubrerythrin  51.75 
 
 
180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00806345  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0077  rubredoxin/rubrerythrin  51.05 
 
 
180 aa  130  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.165154  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0682  rubredoxin/rubrerythrin  51.41 
 
 
180 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0681  rubredoxin/rubrerythrin  50.7 
 
 
180 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0081  rubrerythrin  49.65 
 
 
181 aa  125  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3505  rubrerythrin  48.94 
 
 
180 aa  123  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000134331  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0902  Rubrerythrin  51.06 
 
 
181 aa  110  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197939  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3816  rubrerythrin  43.66 
 
 
180 aa  110  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477508  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2434  rubrerythrin  47.93 
 
 
124 aa  102  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1596  hypothetical protein  50.41 
 
 
127 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  33.33 
 
 
144 aa  57.4  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0296  rubrerythrin  33.33 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.585668 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  33.6 
 
 
178 aa  51.2  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0059  rubrerythrin  30.15 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0465733  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  36.27 
 
 
166 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  30.37 
 
 
191 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  32.85 
 
 
191 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  43.86 
 
 
164 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  30.15 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  30.15 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  29.55 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  30.15 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  42.11 
 
 
164 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  30.15 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  30.15 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  30.15 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  29.63 
 
 
191 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  30.15 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  30.15 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  28.79 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  32.28 
 
 
168 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  28.03 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  29.55 
 
 
140 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  31.62 
 
 
192 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  28.57 
 
 
139 aa  43.9  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  42.62 
 
 
180 aa  44.3  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  35.8 
 
 
168 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  28.79 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  37.7 
 
 
215 aa  43.5  0.0009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  37.14 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  28.03 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  41.94 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  42.42 
 
 
178 aa  42.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  29.84 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  29.41 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  29.41 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  33.85 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  33.01 
 
 
166 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  33.01 
 
 
166 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  34.95 
 
 
168 aa  41.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  33.61 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  31.54 
 
 
179 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  27.27 
 
 
168 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  39.66 
 
 
196 aa  41.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  28.79 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  28.79 
 
 
140 aa  40.8  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  39.66 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  41.07 
 
 
166 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  31.11 
 
 
179 aa  40.8  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  40 
 
 
165 aa  40.4  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  31.19 
 
 
170 aa  40.8  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  28.03 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  28.03 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  28.03 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  31.19 
 
 
170 aa  40.8  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  31.62 
 
 
179 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  39.66 
 
 
165 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  27.21 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  39.29 
 
 
166 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  39.29 
 
 
166 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0899  Rubrerythrin  31.67 
 
 
144 aa  40  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  29.1 
 
 
139 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  30.51 
 
 
146 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  40 
 
 
194 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  40 
 
 
194 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  40 
 
 
196 aa  40  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  40.35 
 
 
165 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>