19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1856 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1856  ruberythrin-like  100 
 
 		 39 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406851  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3363  hypothetical protein  63.16 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.67 
 
 		 216 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.43 
 
 		 520 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0081  rubrerythrin  51.52 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1529  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 		 209 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00138894  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  46.88 
 
 		 884 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2955  rubredoxin/rubrerythrin  48.48 
 
 		 180 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00806345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0099  rubrerythrin  48.48 
 
 		 180 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0220347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2638  rubrerythrin  48.48 
 
 		 188 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000156836  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0063  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.12 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2460  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase or nitrite reductase  41.38 
 
 		 501 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000440664  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0682  rubredoxin/rubrerythrin  45.45 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0077  rubredoxin/rubrerythrin  45.45 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.165154  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  51.72 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0681  rubredoxin/rubrerythrin  39.39 
 
 		 180 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3241  hypothetical protein  41.67 
 
 		 36 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000312443  hitchhiker  0.0015976 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3505  rubrerythrin  48.39 
 
 		 180 aa  40.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000134331  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3816  rubrerythrin  42.42 
 
 		 180 aa  40.4  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>