138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0436 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0436  hypothetical protein  100 
 
 		 802 aa  1646    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  27.93 
 
 		 288 aa  83.2  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  25.89 
 
 		 307 aa  69.7  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  27.19 
 
 		 298 aa  66.6  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  24.25 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  23.28 
 
 		 301 aa  62.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  28.7 
 
 		 280 aa  60.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  29.49 
 
 		 283 aa  60.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  26.1 
 
 		 290 aa  60.8  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  33.01 
 
 		 287 aa  59.7  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  25.31 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.55 
 
 		 145 aa  58.9  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.73 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.12 
 
 		 145 aa  56.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  28.93 
 
 		 156 aa  56.2  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  24.69 
 
 		 297 aa  55.5  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  23.38 
 
 		 303 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.71 
 
 		 145 aa  55.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  31.07 
 
 		 287 aa  54.7  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  31.07 
 
 		 296 aa  54.3  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  24.65 
 
 		 298 aa  54.7  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  30.1 
 
 		 287 aa  53.9  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  26.95 
 
 		 320 aa  53.9  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  28.3 
 
 		 157 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  25.22 
 
 		 304 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  30.54 
 
 		 155 aa  52.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  30.19 
 
 		 143 aa  53.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  27.15 
 
 		 145 aa  52.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  22.09 
 
 		 286 aa  52.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  25.93 
 
 		 145 aa  52.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  24.91 
 
 		 305 aa  52  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  26.88 
 
 		 139 aa  52.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  25.35 
 
 		 300 aa  52.4  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  29.61 
 
 		 144 aa  52  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  29.37 
 
 		 142 aa  52.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  25.55 
 
 		 291 aa  51.6  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  21.58 
 
 		 415 aa  51.6  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  26.41 
 
 		 306 aa  51.2  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  26.52 
 
 		 309 aa  51.2  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  27.74 
 
 		 141 aa  50.8  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  26.3 
 
 		 321 aa  50.8  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  28.4 
 
 		 173 aa  50.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  24.11 
 
 		 295 aa  50.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 		 293 aa  50.8  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  30.57 
 
 		 140 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  26.09 
 
 		 286 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3808  UspA domain protein  28.93 
 
 		 147 aa  50.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 145 aa  49.7  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  27.49 
 
 		 148 aa  50.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  26.09 
 
 		 286 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0159  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 157 aa  49.7  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906584  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  26.58 
 
 		 147 aa  50.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  26.13 
 
 		 281 aa  49.7  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  27.04 
 
 		 153 aa  48.9  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  27.16 
 
 		 140 aa  49.3  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  21.43 
 
 		 314 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 144 aa  48.9  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  25.12 
 
 		 309 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  38.46 
 
 		 140 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  26.54 
 
 		 154 aa  48.9  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  25.6 
 
 		 155 aa  48.5  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  25.12 
 
 		 291 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  37.21 
 
 		 140 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  37.18 
 
 		 140 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  23.49 
 
 		 154 aa  48.1  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  25 
 
 		 140 aa  48.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03760  universal stress protein UspA-like protein  28.07 
 
 		 154 aa  48.1  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00361063  normal  0.318246 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  26.09 
 
 		 148 aa  47.8  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  25.93 
 
 		 306 aa  48.1  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  30.06 
 
 		 147 aa  47.8  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  28.57 
 
 		 159 aa  47.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  25.97 
 
 		 138 aa  47.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  26.61 
 
 		 294 aa  47.8  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  26.32 
 
 		 297 aa  47.8  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  35.9 
 
 		 140 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  27.27 
 
 		 139 aa  47.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  35.9 
 
 		 140 aa  47  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  22.8 
 
 		 307 aa  47.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  35.9 
 
 		 140 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  25.61 
 
 		 154 aa  47  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  26.25 
 
 		 145 aa  47.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  30.63 
 
 		 291 aa  47  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  30.32 
 
 		 158 aa  47.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 140 aa  47  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  25.47 
 
 		 143 aa  47.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  35.9 
 
 		 140 aa  47  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 318 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  26.15 
 
 		 283 aa  47  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  35.9 
 
 		 140 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  35.9 
 
 		 140 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  27.78 
 
 		 153 aa  47.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  26.19 
 
 		 149 aa  47.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  30.11 
 
 		 275 aa  47.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  35.9 
 
 		 140 aa  47  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  28.48 
 
 		 150 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  25.62 
 
 		 147 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  23.27 
 
 		 142 aa  47  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  26.42 
 
 		 147 aa  46.2  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  27.16 
 
 		 148 aa  46.6  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  23.57 
 
 		 144 aa  46.6  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>