More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_03760 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_03760  universal stress protein UspA-like protein  100 
 
 
154 aa  310  4.999999999999999e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00361063  normal  0.318246 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2020  UspA domain protein  37.65 
 
 
165 aa  87.4  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000426305 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16290  universal stress protein UspA-like protein  37.82 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000127865  hitchhiker  0.0000372029 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01240  universal stress protein UspA-like protein  38.75 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14760  universal stress protein UspA-like protein  38.51 
 
 
160 aa  84.7  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0107987 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  38.31 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  32.26 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  34.19 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3008  UspA domain protein  34.16 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.396305 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  31.85 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  30.82 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  33.12 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  34.19 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  31.85 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  31.85 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  31.85 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  31.45 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  31.85 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  31.85 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  30.82 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  34.19 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  37.42 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  32.08 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  32.69 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  30.97 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  38.06 
 
 
288 aa  65.5  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  33.77 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  31.85 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  30.25 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  33.77 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  34.42 
 
 
159 aa  62.8  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  30.13 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  34.62 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  29.61 
 
 
274 aa  61.6  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  37.25 
 
 
320 aa  61.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  32.52 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.05 
 
 
143 aa  60.8  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  33.54 
 
 
138 aa  60.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  32.9 
 
 
141 aa  60.5  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.41 
 
 
180 aa  60.5  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  31.61 
 
 
317 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  34.36 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  34.18 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  29.52 
 
 
169 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  35.26 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.61 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  35.22 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  29.22 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  32.5 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  30.13 
 
 
283 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  30.72 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0206  UspA domain protein  31.58 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00002541  normal  0.702914 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  29.45 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  28.39 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  29.87 
 
 
150 aa  57.4  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  33.97 
 
 
140 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  29.87 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  29.81 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28.39 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  31.65 
 
 
208 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  32.91 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  31.87 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  30.57 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.32 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  35.67 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  29.68 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  30.72 
 
 
515 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  29.3 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  32.7 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  32.05 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  31.82 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  31.61 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.32 
 
 
145 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  32.9 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  31.37 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  30.67 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  31.21 
 
 
314 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  33.97 
 
 
162 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  36.9 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  32.26 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  29.87 
 
 
276 aa  54.7  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.52 
 
 
145 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  33.97 
 
 
162 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.9 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  30.32 
 
 
138 aa  54.3  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  31.82 
 
 
155 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  32.9 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  31.01 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  32.68 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  52.83 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  31.79 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  32.8 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  29.81 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  29.03 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  31.52 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>