More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1658 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  100 
 
 		 287 aa  565  1e-160  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  50.34 
 
 		 286 aa  249  4e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  46.34 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  43.92 
 
 		 288 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  41.98 
 
 		 307 aa  178  8e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  39.79 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  38.19 
 
 		 281 aa  166  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  37.79 
 
 		 305 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  34.83 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  39.86 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  35.76 
 
 		 283 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  33.22 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  33.45 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  36.95 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  34.13 
 
 		 415 aa  122  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  48.18 
 
 		 207 aa  115  8.999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.57 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  47.14 
 
 		 180 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  45.99 
 
 		 208 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  33.45 
 
 		 311 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  34.78 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  42.86 
 
 		 152 aa  100  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  43.36 
 
 		 152 aa  99.4  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 317 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  41.1 
 
 		 155 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  41.43 
 
 		 144 aa  97.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 		 148 aa  95.9  7e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  32.78 
 
 		 291 aa  95.9  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  31.1 
 
 		 281 aa  95.5  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  28.85 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  44.2 
 
 		 138 aa  93.2  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  36.26 
 
 		 169 aa  92.8  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  32.53 
 
 		 294 aa  92.8  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  41.1 
 
 		 153 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  35.51 
 
 		 153 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0501  UspA domain-containing protein  25.51 
 
 		 283 aa  90.5  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  29.86 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  28.43 
 
 		 449 aa  90.1  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  39.6 
 
 		 156 aa  90.1  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  27.42 
 
 		 291 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  38.51 
 
 		 148 aa  89.4  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  35.86 
 
 		 152 aa  89.4  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4486  hypothetical protein  25.76 
 
 		 306 aa  89.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  42.96 
 
 		 147 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  34.27 
 
 		 152 aa  88.6  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  30.85 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  34.04 
 
 		 153 aa  87  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  35.21 
 
 		 150 aa  87  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 		 143 aa  87.4  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  31.25 
 
 		 164 aa  87  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  35.53 
 
 		 157 aa  86.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  37.67 
 
 		 156 aa  86.7  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  41.13 
 
 		 158 aa  86.3  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  37.06 
 
 		 150 aa  86.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  26.01 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  33.47 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 145 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 145 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  32.17 
 
 		 152 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  33.09 
 
 		 150 aa  84.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  31.32 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  36.96 
 
 		 142 aa  84  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 153 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  34.51 
 
 		 151 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  40.29 
 
 		 159 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  27.3 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  39.86 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  30.46 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  37.24 
 
 		 149 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  32.95 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  38.19 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.51 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  28.62 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  39.13 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 144 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  27.67 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  41.22 
 
 		 158 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  36.99 
 
 		 151 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  37.16 
 
 		 144 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  37.32 
 
 		 146 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  33.1 
 
 		 147 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  33.1 
 
 		 147 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  37.41 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  34.03 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  36.99 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  39.57 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  34.9 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  30.17 
 
 		 325 aa  79  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  31.1 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  36.88 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2019  universal stress protein UspE  26.45 
 
 		 309 aa  79  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.865134  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3500  UspA domain protein  23.92 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  29.43 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>