More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3533 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  100 
 
 
305 aa  601  1.0000000000000001e-171  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  48.99 
 
 
297 aa  215  9e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  44.41 
 
 
283 aa  202  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  43.1 
 
 
286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  41.14 
 
 
288 aa  179  4.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  40 
 
 
281 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  37.79 
 
 
287 aa  166  5e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  40.13 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  38.89 
 
 
307 aa  156  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  36.96 
 
 
290 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  37.9 
 
 
304 aa  142  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  35.6 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  33.44 
 
 
320 aa  129  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  36.21 
 
 
415 aa  123  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  33.99 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  34.3 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 
449 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  33.33 
 
 
283 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
291 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  30.52 
 
 
297 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  30.1 
 
 
297 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  39.88 
 
 
156 aa  99.8  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  44.29 
 
 
159 aa  99  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  41.77 
 
 
152 aa  98.2  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  42.38 
 
 
180 aa  98.2  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  45.39 
 
 
144 aa  97.4  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  43.75 
 
 
208 aa  95.9  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  33.22 
 
 
295 aa  95.5  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  31.05 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  32.69 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  40.85 
 
 
152 aa  94.7  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 
145 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  39.16 
 
 
153 aa  93.6  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 
145 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  31.41 
 
 
324 aa  92.4  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  41.04 
 
 
136 aa  92  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 
145 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  42.86 
 
 
156 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  27.27 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 
145 aa  91.7  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  35.86 
 
 
150 aa  91.3  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  29.58 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  30.26 
 
 
289 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  37.86 
 
 
147 aa  90.5  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  26.06 
 
 
295 aa  89.7  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  27.63 
 
 
288 aa  89.4  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  25.89 
 
 
287 aa  89  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  40.58 
 
 
138 aa  89.4  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  42.86 
 
 
153 aa  89  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  33.56 
 
 
150 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  26.89 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  43.57 
 
 
159 aa  87.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  28.27 
 
 
317 aa  87  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  37.27 
 
 
155 aa  86.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  25.82 
 
 
278 aa  87  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36.08 
 
 
144 aa  87  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.86 
 
 
149 aa  86.3  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  39.73 
 
 
207 aa  86.3  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 
151 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 
148 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  31.49 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  24.6 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  29 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 
156 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  40.14 
 
 
148 aa  83.6  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  36.9 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  29.28 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  38.67 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  28.62 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  43.17 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  28.93 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
143 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  23.33 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  34.31 
 
 
153 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.87 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  35.57 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  40.85 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  26.23 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  36.31 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  35.86 
 
 
150 aa  79  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  35.86 
 
 
151 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  27.42 
 
 
313 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  28.16 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 
148 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
140 aa  79  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  25.83 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  31.44 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  30.62 
 
 
288 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  30.26 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 
306 aa  77  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  31.44 
 
 
315 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  31.44 
 
 
315 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  34.29 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  34.29 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  30.38 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  29.28 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5859  UspA domain-containing protein  29.24 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689351  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  40.15 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  34.87 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  34.19 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>